Лаборатория трансляционной медицины и биоинформатики

Информация о материале
Uncategorised
Просмотров: 5772
Содержание:

NaukaUniv

Национальный проект "Наука и университеты" в ИИФ УрО РАН

Национальный проект «Наука и университеты» реализуется согласно указам Президента Российской Федерации от 7 мая 2018 г. № 204 «О национальных целях и стратегических задачах развития Российской Федерации на период до 2024 года» и от 21 июля 2020 г. № 474 «О национальных целях развития Российской Федерации на период до 2030 года». Его ключевая задача — воспитание и поддержка нового поколения ученых. В рамках нацпроекта «Наука и университеты» выделяются значительные средства на поддержку ученых и создание научных центров с первоклассными условиями для исследовательской работы. 

В рамках национального проекта в Институте иммунологии и физиологии УрО РАН в 2019 году была создана Лаборатория трансляционной медицины и биоинформатики.

Заведующий лабораторией – Щепкин Даниил Владимирович, к.б.н.

Тел. (343) 374-08-39, доб. 133
E-mail:  Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.

Molod laba

 

Состав лаборатории
к содержанию

В штате лаборатории 14 сотрудников, в том числе 2 кандидата наук
  Фамилия Имя Отчество Должность, ученая степень и звание ORCID, ключевые слова Телефон рабочий E-mail
khokhlova  Щепкин Даниил Владимирович

Старший научный сотрудник,

заведующий лабораторией,

к.б.н.

orchid

кардиомиоцит, тропомиозин, миозин связывающий белок С

 +7 (343) 374-00-70  Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
Gerzen  Герцен Оксана Павловна

научный сотрудник,
к.б.н.

orchid

миокард, актин-миозиновое взаимодействие, кардиотоксичность, физическая нагрузка

 8(343)  Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
  Байкенова Мадина Багатчановна

Младший научный сотрудник,

 

orchid

сахарный диабет, ожирение, печень, инсулин-позитивные клетки

    Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
  Белоусова Анна Викторовна

Младший научный сотрудник,

 

 

 

    @iip.uran.ru
  Бельдия Евгения Александровна

Лаборант-исследователь

 

 

миокард, актин-миозиновое взаимодействие, кальциевая регуляция, in vitro подвижная система

    @iip.uran.ru
  Бутова Ксения Андреевна

Младший научный сотрудник

 

 

orchid

биофизика миокарда, кардиомиоцит, неоднородность миокарда, фибрилляция предсердий

 8(343) 374-08-39, доб. 133  Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.

 		 Кочурова Анастасия Михайловна

Младший научный сотрудник

 

 

orchid

миокард, актин-миозиновое взаимодействие, кальциевая регуляция, in vitro подвижная система, сердечная недостаточность, сахарный диабет

    Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.

 		 Мячина Татьяна Анатольевна

Младший научный сотрудник

 

 

orchid

кардиомицит, предсердия и желудочки, электромеханическое сопряжение, внутриклеточная неоднородность, сахарный диабет, гипоэстрогения

 8(343) 374-08-39, доб. 133  Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
  Симонова Раиса

биолог-исследователь

 

 

биофизика миокарда, кардиомиоцит, неоднородность миокарда

    @iip.uran.ru

 		 Демичева Екатерина Ивановна

математик-исследователь

 

 

 

биоинформатика, сердечно-сосудистые заболевания

    Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
 
 

Молодые ученые о лаборатории
к содержанию

Лаборатория трансляционной медицины и биоинформатики (ЛТМиБ) прогрессивно развивается и интенсивно эволюционирует с 2019 года. ЛТМиБ собрала под своим крылом молодых учёных самых разных направлений – биологов, физиков, химиков, математиков и, возможно, это ещё не полный перечень!

Что же объединяет эти юные умы? Гос. задание Института? Да, это так. Но ещё их объединяет боевой настрой, неутолимая кофеином жажда знаний в глазах и неугомонное стремление трудиться во благо науки круглые сутки!

Искренняя любовь молодых ученых к науке, желание – и даже страсть – узнать истину и понять систему на разных уровнях организации оставляет неизгладимое впечатление! А крысы прячутся при виде их горящих (с одобрения комиссии по биоэтике) взглядов!

Трансляционная медицина и биоинформатика – это новые и невероятно актуальные направления науки, поэтому, мы верим, что ЛТМиБ семимильными шагами приближает светлое будущее персонифицированной (и не только) медицины.

Авторы: Оксана П. Герцен и Ксения А. Бутова 

Основные направления исследований
к содержанию

  • особенности регуляции механической функции кардиомиоцитов и актин-миозинового взаимодействия в различных отделах сердца в норме и при патологии
  • исследование молекулярно-клеточных механизмов нарушения механической активности предсердий и желудочков при сердечной недостаточности
  • исследование влияния интоксикации солями и наночастицами свинца и/или кадмия на механическую функцию миокарда на молекулярном уровне и поиск способов коррекции
  • исследование влияния фармакологических модуляторов на механическую функцию кардиомиоцитов и сократительных белков саркомера в различных регионах сердца
  • внепанкреатические инсулин-продуцирующие системы при моделировании сахарного диабета 1 и 2 типа и его коррекции
  • тучные клетки в мужской репродуктивной системе и их влияние на сперматогенез
  • использование машинного обучения и методов биоинформатики для автоматической обработки медико-биологических данных

Важнейшие результаты
к содержанию

  1. С использованием уникальных методик регистрации взаимодействия сократительных белков исследовано нарушение функции сократительных белков миокарда при интоксикации солями тяжелых металлов (свинец, кадмий).
  2. Изучено влияние фармацевтического активатора сердечного миозина CK-1827452, омекамтив мекарбила, на кальциевую регуляцию актин-миозинового взаимодействия и сократительную активность кардиомиоцитов предсердий и желудочков.
  3. Разработаны и усовершенствованы методы экспериментальные исследования активности изолированных кардиомиоцитов в норме и при патологии различного генеза. Предложен новый метод выделения жизнеспособных одиночных кардиомиоцитов из сердечной ткани. Разработан новый метод оценки сократительной активности, динамики внутриклеточного Са2+ и распределения t-тубулярной системы в различных регионах одиночного кардиомиоцита
  4. Для изучения пассивных вязкоупругих и активных сократительных свойств интактных одиночных кардиомиоцитов разработаны биомеханические протоколы с использованием методики четырёх карбоновых волокон, реализуемой с помощью системы цифрового манипулирования
  5. Исследованы межкамерные различия сократительной функции одиночных кардиомиоцитов и сократительных белков саркомера при экспериментальном сахарном диабете у крыс.
  6. Проведены исследования механизмов патогенеза ряда социально-значимых заболеваний на экспериментальных моделях у животных. Исследованы особенности инсулин-позитивных клеток в печени здоровых животных и при экспериментальном сахарном диабете у крыс.
  7. Разработаны экспериментальные модели таких социально-значимых заболеваний, как хроническая обструктивная болезнь легких и фибрилляция предсердий у крыс.
  8. Разработаны новые подходы использования нейронных сетей и регрессионного анализа для автоматической обработки данных, полученных при гистологических исследованиях, а также различными инструментальными методами исследований.

Проекты, гранты
к содержанию

Текущие проекты:

  1. Проект РНФ №22-75-10134 «Эндокринная регуляция сократимости миокарда жировой тканью сердца при фибрилляции предсердий», 2022-2025 (руководитель: – Бутова К.А.).
  2. Проект РНФ №22-74-00128 "Исследование молекулярных механизмов прямого влияния ионов свинца и кадмия на механическую функцию миокарда", 2022-2024 (руководитель: Герцен О.П.).
  3. Проект РНФ №24-75-10118 "Исследование терапевтического потенциала активаторов миозина: революционный подход к предотвращению атрофии и улучшению сократительных свойств медленной постуральной мышцы при функциональной разгрузке (disuse)", 2024-2027 (руководитель: Герцен О.П.).

Завершенные проекты:

  1. РНФ № 18-74-10059 «Исследование молекулярно-клеточных механизмов нарушения механической активности миокарда предсердий и желудочков при сердечной недостаточности» (руководитель: Хохлова А.Д., исполнители: Мячина Т.А., Волжанинов Д.А., Берг В.Ю.)
  2. РНФ 21-15-00169 «Ремоделирование структуры и функции правого предсердия и желудочка при легочно-сердечной недостаточности» (руководитель: Проценко Ю.Л., исполнители: Бутова К.А., Герцен О.П.)
  3. РФФИ № 20-315-70006 «Исследование влияния локальной продукции эстрадиола жировой тканью сердца на электромеханическое сопряжение в миокарде желудочков и предсердий» (руководитель: Хохлова А.Д., исполнители: Мячина Т.А., Бутова К.А., Волжанинов Д.А., Берг В.Ю.)
  4. РФФИ № 21-54-15001 НЦНИ_а «Внутриклеточная неоднородность электромеханического сопряжения в миокарде» (руководитель: Лукин О.Н., исполнители: Хохлова А.Д., Мячина Т.А., Бутова К.А.)
  5. РФФИ 20-31-90106 аспиранты «Исследование межжелудочковых особенностей длинозависимой и грузозависимой регуляции механической функции одиночных кардиомиоцитов» (руководитель: Соловьева О.Э, исполнитель: Волжанинов Д.А.)
  6. РНФ № 22-74-00128 «Исследование молекулярных механизмов прямого влияния ионов свинца и кадмия на механическую функцию миокарда» (руководитель: к.б.н. Герцен О.П.).
  7. РНФ № 16-15-00039 (2018-2020) «Поиск средств фармакологической коррекции регенераторных процессов при экспериментальном моделировании сахарного диабета» (руководитель: Данилова И.Г., исполнитель: Байкенова М.Б.)
  8. MK-949.2019.4 (2019-2020) «Исследование влияния механической нагрузки на сократительную функцию одиночных кардиомиоцитов предсердий и желудочков» (руководитель: Хохлова А.Д., исполнители: Мячина Т.А., Бутова К.А., Волжанинов Д.А.)
  9. РФФИ № 20-04-00130 «Исследование влияния мутаций в гене TPM1, ассоциированных с врожденными заболеваниями сердца, на структурные и функциональные характеристики альфа- и каппа-изоформ тропомиозина» (руководитель: Бершицкий С.Ю., исполнитель: Кочурова А.М.)
  10. РФФИ № 18-04-00572 «Инактивирующий эффект систолического укорочения и метод его оценки при определении сократительного потенциала миокарда» (руководитель: Лукин О.Н., исполнитель: Бутова К.А.)
  11. РФФИ № 18-015-00252 А «Роль модуляции функции изоформ сердечного миозина в механизме кальциевой регуляции актин-миозинового взаимодействия в норме и при патологии» (руководитель: Бершицкий С.Ю., исполнитель: Берг В.Ю.)
  12. РФФИ (КОМФИ) № 17-00-00070 (2017-2019) «Экспериментальное исследование влияния фосфорилирования тропомиозина, несущего кардиомиопатические мутации, на функциональные характеристики актин-миозинового взаимодействия в миокарде» (руководитель: Бершицкий С.Ю., исполнитель: Берг В.Ю.)

Награды лаборатории
к содержанию

2021

  • Благодарность Главы Екатеринбурга – Хохлова А.Д.
  • Премия Губернатора Свердловской области за лучшую работу в области физиологии – Герцен О.П.
  • Лучший устный доклад симпозиума “Экспериментальные и компьютерные модели в сердечно-сосудистой физиологии и кардиологии” в рамках конференции “Экспериментальная и компьютерная биомедицина – Мячина Т.А.
  • Лучший устный доклад на XXVII Всероссийской конференции молодых учёных с международным участием «Актуальные проблемы биомедицины — 2021» в секции “Физиология висцеральных систем” 25–26 марта 2021 года – Бутова К.А.
  • Лучший устный доклад на XXVII Всероссийской конференции молодых учёных с международным участием «Актуальные проблемы биомедицины — 2021» в секции “Физиология висцеральных систем” 25–26 марта 2021 года – Кочурова А.М.
  • Грант Министерства образования и молодежной политики на реализацию научно-популярного проекта “Поговорим о науке” – Герцен О.П., Мячина Т.А., Бутова К.А.
  • Российско-немецкий science slam (конкурс научно-популярных докладов среди молодых ученых России и Германии) – Герцен О.П.
  • Лучший устный доклад VIII Международная молодежная научная конференция Физика. Технологии. Инновации ФТИ 2021. Екатеринбург. Уральский Федеральный университет имени первого Президента России Б.Н. Ельцина Физико-технологический Институт. 17.05.2021-21.05.2021 – Волжанинов Д.А.

2022

  • Почетная грамота УрО РАН – Щепкин Д.В.
  • Грамота ИИФ УрО РАН – Бутова К.А.
  • Благодарность ИИФ УрО РАН – Кочурова А.М.
  • Благодарность ИИФ УрО РАН – Симонова Р.А.
  • Благодарность ИИФ УрО РАН – Мячина Т.А.
  • Благодарность ИИФ УрО РАН – Ушенин К.С.
  • Благодарность ИИФ УрО РАН – Герцен О.П.
  • Диплом II степени за лучший доклад на IV Всероссийской (XIX) молодежной научной школе-конференции «Молодежь и наука на Севере – 2022» в секции “Физиология сердечно-сосудистой системы» - Бутова К.А.
  • Диплом I степени за лучший доклад на XXVII Всероссийской конференции молодых учёных с международным участием «Актуальные проблемы биомедицины – 2022» в студенческой секции “Висцеральные системы” – Бельдия Е.А.
  • Диплом II степени за лучший доклад на XXVII Всероссийской конференции молодых учёных с международным участием «Актуальные проблемы биомедицины – 2022» в студенческой секции “Физиология висцеральных систем №1” – Кочурова А.М.
  • Диплом III степени за лучший доклад на XXVII Всероссийской конференции молодых учёных с международным участием «Актуальные проблемы биомедицины – 2022» в студенческой секции “Гуморальные механизмы регуляции физиологических функций и регуляция движения” – Симонова Р.А.
  • Диплом за лучший доклад на Всероссийской междисциплинарной молодежной научной конференции с международным участием «X информационная школа молодого ученого» по теме “Исследование тропомодулина в качестве регулятора мышечного сокращения” – Бельдия Е.А.
  • Диплом за актуальную и практическую значимость исследования “Влияние сердечного миозин-связывающего белка С на кальциевую регуляцию актин-миозинового взаимодействия в миокарде желудочков” на Всероссийской междисциплинарной молодежной научной конференции с международным участием «X информационная школа молодого ученого» – Кочурова А.М.
  • Стипендия Президента РФ для аспирантов – Бутова К.А.
  • Стипендия Правительства РФ для аспирантов – Бутова К.А.
  • Стипендия Президента РФ для аспирантов – Кочурова А.М.
  • Стипендия Правительства РФ для аспирантов – Кочурова А.М.
  • Диплом I степени за лучшее выступление на Всероссийском соревновании в виде коротких выступлений учёных с рассказами о своих научных исследованиях в научно-популярной форме Science Slam – Герцен О.П.

2023

  • Нагрудный знак «Молодой ученый» – Хохлова А.Д.
  • Благодарственное письмо ИИФ УрО РАН – Волжанинов Д.А.
  • Первая премия и памятный подарок на IV молодежной школе-конференции «Молекулярные механизмы регуляции физиологических функций», Звенигород, 15–17 сентября 2023 г. – Кочурова А.М.
  • Диплом победителя на IX региональной научно-практической конференции молодых учёных и специалистов «Научные достижения генетики и биотехнологии в ветеринарной медицине и животноводстве» в номинации «Инновационное решение научных задач», Екатеринбург, 27 апреля 2023 г. – Демичева Е.И.
  • Диплом за второе место по секции: "Современные проблемы биофизики, физиологии, биологического образования, биомедицины и нейронауки" на международной научной конференции студентов и молодых ученых «Фараби Əлемі». Алматы (Казахстан), 6-8 апреля 2023 г. – Бельдия Е.А.
  • Диплом 1 степени в конкурсе докладов студентов магистратуры на II региональной молодежной научно-практической конференции обучающихся ИЕНиМ, посвященной 100-летию естественно-научного и математического образования на Урале и 35-летию научно-исследовательского института физики и прикладной математики (НИИ ФПМ) ИЕНиМ УрФУ, Бельдия Е.А.
  • Диплом II степени за доклад на секции молодых учёных XXIX Всероссийской конференции молодых учёных с международным участием «Актуальные проблемы биомедицины – 2023» – Бутова К.А.
  • Диплом за лучший доклад на третьей международной конференции «Врач – пациент – общество: иммунология, генетика и закон» – Мячина Т.А.

2024

  • Благодарственное письмо адиминистрации Екатеринбурга – Герцен О.П.
  • Победа в конкурсе "Молодой исследователь" г.Березовского – Герцен О.П.
  • Диплом «III место» за доклад «Сердечный миозин-связывающий белок С по-разному модулирует активацию тонкой нити в предсердиях и желудочках» в конкурсе постерных докладов молодых ученых XI Всероссийской с международным участием школы-конференции по физиологии мышц и мышечной деятельности, посвященной 70-летию открытия механизма мышечного сокращения. 22–25 апреля 2024 г. Москва. ГНЦ РФ – ИМБП РАН. – Кочурова А.М.
  • Диплом 1 степени в конференции «VIII Международная конференция Современные синтетические методологии для создания лекарственных препаратов и функциональных материалов» (г. Екатеринбург, 9-13 июня 2024 г.) за доклад: «Липиды - потенциальные биомаркеры иммунодефицитных состояний» – Демичева Е.И.
  • Благодарственное письмо от Администрации города Екатеринбурга – Бутова К.А.
  • Диплом участника конкурса на соискание премии Губернатора Свердловской области за работу «Механизмы сократительной дисфункции миокарда левого и правого предсердий при пароксизмальной фибрилляции предсердий» – Бутова К.А.
  • Благодарственное письмо от Администрации города Екатеринбурга – Мячина Т.А.
  • Диплом лауреата премии Губернатора Свердловской области за лучшую работу в области физиологии за работу « Особенности функционального ремоделирования предсердий и желудочков при эндокринных нарушениях» – Кочурова А.М., Мячина Т.А.
В