Фамилия Имя Отчество | Должность, ученая степень и звание | ORCID, ключевые слова | Телефон рабочий | ||
Соловьева Ольга Эдуардовна |
зав. лаб., д.ф.-м.н. профессор |
биофизика, физиология сердца, математическое моделирование, кардиология, прикладная математика, вычислительная физиология, компьютерная математика, математическая биология |
+7(343) 374-00-70 |
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript. | |
Кацнельсон Леонид Борисович | вед.н.с. д.ф.-м.н. |
биофизика мышечных сокращений, биомеханика миокарда, электромеханическое сопряжение и механо-электрические обратные связи в сердечной мышце, математическое моделирование |
+7(343) 362-34-65 |
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript. | |
Балакина-Викулова Наталия Алексеевна | ст.н.с., к.ф.-м.н. |
математические модели сердечной мышцы; электромеханическое сопряжение и механоэлектрические обратные связи в сердце |
+7(343) 362-34-77 |
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript. | |
Коновалов Павел Владимирович | ст.н.с., к.б.н. |
возбудимые среды, спиральная волна; трехмерные вихри; сердечная мышца; связь возбуждения-сокращения; электромеханическая математическая модель; механоэлектрическая обратная связь |
+7(343) 362-34-77 |
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript. | |
Курсанов Александр Геннадьевич | ст.н.с., к.ф.-м.н. |
биофизические модели сердечной мышцы, электромеханическое сопряжение в сердечной ткани, межклеточное взаимодействие в миокарде |
+7(343) 362-34-41 |
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript. | |
Чумарная Татьяна Владиславовна | ст.н.с., к.б.н. |
Клинико-физиологические исследования сердца, эхокардиография, функциональная геометрия левого желудочка сердца, информационные модели прогноза, биостатистика |
+7(343) 362-34-41 |
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript. | |
Мангилева Дарья Владимировна | м.н.с. |
математическое моделирование, 3D модели сердца, обработка изображений |
+7(343) 362-00-61 |
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript. | |
Нестерова Татьяна Михайловна | м.н.с., |
модели электрофизиологии кардиомиоцитов, популяции моделей, старение, кардиомиоциты предсердий, хроническая фибрилляция предсердий, дофетилид |
+7(343) 362-00-61 |
Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript. |
C 2016 года лаборатория носит имя В.С. Мархасина.
Исследования лаборатории математической физиологии ИИФ УрО РАН выполняются в рамках государственного задания по теме: "Экспериментальное и теоретическое исследование интеграции механизмов регуляции функции сердечной мышцы от молекул до органа в норме и при патологии" (Регистрационный номер НИОКТР №АААА-А18-118020590031-8), 2013-2021 гг.
- математическое моделирование электромеханического сопряжения в неоднородном миокарде на клеточном, тканевом и органном уровне с учетом механо-электрических, механо-кальциевых и механо-метаболических обратных связей (одномерные, двумерные, трехмерные модели миокардиальной ткани);
- математическое моделирование нарушений сократительной функции миокарда при различных патологиях сердца, в т.ч. при ишемии, инфаркте и сердечной недостаточности;
• математическое моделирование функции сердца при возрастных изменениях; - популяционное моделирование изменений электрической активности кардиомиоцитов предсердия, вызванных старением, хронической фибрилляцией предсердий и действующими веществами (дофетилидом).
- исследование механизмов регуляции кальцием вызванного высвобождения кальция в рамках биофизических моделей суб-клеточного и клеточного уровня;
- клинико-физиологическое исследование функции сердца в норме, при сердечно-сосудистой патологии с различной степенью выраженности нарушений электрической и сократительной функции и геометрического ремоделирования сердца.
Важнейшие результаты
Разработаны математические модели сократительной функции миокарда на разных уровнях его организации: от клетки до целого желудочка.
Совместно с коллегами из лаборатории электрофизиологии Д. Нобла из Оксфордского Университета разработана модель «Екатеринбург-Оксфорд» электромеханического сопряжения (ЭМС) в кардиомиоцитах (Sulman ea, Bul. Math. Biol, 2008). Ключевым элементом модели являются механизмы кооперативности регуляторных и сократительных белков, объясняющие широкий спектр механо-электрических и механо-кальциевых обратных связей в миокарде. Эта модель использована для анализа нарушений сердечного ритма и механической функции при перегрузке кардиомиоцитов кальцием (Sulman ea, Bul. Math. Biol, 2008; Katsnelson ea, J. Theor. Biol. 2011).
Модификации, внесённые в рамках математических моделей в концепцию кооперативности регуляторных и сократительных белков, позволили снять противоречия, имевшиеся между проявлениями этой кооперативности в экспериментах на интактных препаратах миокарда, с одной стороны, и скинированной сердечной мышц, с другой (Shikhaleva ea, Computing in Cardiology, 2015; Докучаев и др., Биофизика, 2016).
Одним из важных результатов исследований последних лет было создание видоспецифических моделей кардиомиоцитов и миокардиального волокна на основе переработанной модели "Екатеринбург-Оксфорд" - например, модели ЭМС в эндо- и эпи- клетках левого желудочка морской свинки (Khokhlova ea, J.Physiol. Sci., 2017), в кардиомиоцитах крысы (Katsnelson ea, Comp in Cardiol, 2018) и человека (Balakina-Vikulova ea, J Physiol Sciences. 2020). В 2018-2020 гг. были опубликованы новые результаты экспериментально-теоретического исследования, проведённого в сотрудничестве с физиологами, изучающими механо-кальциевые обратные связи на изолированных кардиомиоцитах мышей, и посвящённого трансмуральной неоднородности кардиомиоцитов в стенке желудочка (Khokhlova ea, J Mol Cell Cardiol, 2018, Khokhlova ea, Frontiers in Physiol, 2020).
С использованием методов популяционного моделирования исследовано влияние старения на электрическую функцию кардиомиоцитов предсердия (Nesterova ea, Bio Web Conf, 2020). В построенных популяциях математических моделей воспроизводятся экспериментальные данные по возрастному изменению амплитуды, уровня плато и длительности потенциала действия, амплитуды кальциевого перехода. Проведённое моделирование воздействия на данные популяции антиаритмического препарата III класса — дофетилида показало, что чувствительность к дофетилиду у здоровых людей с возрастом снижается. Разработаны модели, описывающие особенности ионной динамики и процессов генерации потенциала действия в клетках водителя сердечного ритма при старении, а также в онтогенезе (Markov& Ryvkin, USBEREIT, 2019).
На основе клеточных моделей построены модели механической и электрической активности многоклеточного миокарда на разных уровнях: от одиночного волокна (Vikulova ea, J. Math. Biol., 2016; Khokhlova ea, Comp. in Biol. Medicine, 2017) - до целого левого желудочка (ЛЖ) (Pravdin ea, PLoS ONE, 2014; Pravdin ea, Mathematics. 2020).
Разработаны модели динамики ионов кальция в сердечных клетках, учитывающие сложную структуру внутриклеточной кальций-высвобождающей системы, позволяющие детально описать процессы, связанные с процессами высвобождения кальция в сердечных клетках (Markov& Ryvkin, USBEREIT, 2020).
Впервые проведена оценка количественных показателей пространственно-временной неоднородности кинетики стенки левого желудочка сердца и описаны динамические изменения индексов формы левого желудочка во время сердечного цикла в норме и при разных видах сердечно-сосудистой патологии, в частности при ишемической болезни сердца, дилатационной кардиомиопатии, при ортотопической трансплантации сердца, позволившие сформулировать представление о новой физиологической характеристике – функциональной геометрии сердца. Проведена оценка показателей функциональной геометрии сердца в онтогенезе.
Научное сотрудничество
- Department of Physiology, Anatomy and Genetics, University of Oxford, UK;
- The Institute for Experimental Cardiovascular Medicine, Freiburg, Germany;
- Ghent University, Department of Physics and Astronomy, Belgium;
- Thomas J. Watson Research Center, IBM, USA;
- Okayama University, Japan; Asahikawa Medical University, Department of Physiology, Japan;
- École Polytechnique, France;
- Уральский федеральный университет им. первого Президента РФ Б.Н. Ельцина, Научная лаборатория ”Математическое моделирование в физиологии и медицине с использованием суперкомпьютерных технологий”, Екатеринбург;
- Областная клиническая больница (ОКБ) №1, Екатеринбург;
- Уральский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения РФ, Екатеринбург;
- Уральский научно-исследовательский институт охраны материнства и младенчества МЗ РФ, Екатеринбург;
- Национальный медицинский исследовательский центр им. В.А. Алмазова, Санкт-Петербург;
- Институт математики и механики РАН, Екатеринбург;
- Институт механики МГУ, Москва;
- Научный центр сердечно-сосудистой хирургии им. А.Н. Бакулева Российской академии медицинских наук, Москва;
- Институт физиологии Коми НЦ, Сыктывкар;
- Суперкомпьютер «УРАН» ИММ УрО РАН;
- Вычислительный кластер УрФУ.
- 19-14-00134, РНФ «Разработка гибридного метода биофизического моделирования электромеханической функции миокарда и машинного обучения для повышения эффективности диагностики и лечения хронической сердечной недостаточности» 2019-2021 гг. (рук. Соловьева О.Э.)
- Проект 21-14-00226, РНФ «Аритмогенная роль пограничной зоны миокарда при ишемии и реперфузии сердца: in vivo, in vitro, in silico» поддержан Российским научным фондом 2021-2023 гг. (рук. Кацнельсон Л.Б.)
- СП-5654.2021.4. Министерство науки и высшего образования, стипендия Президента Российской Федерации молодым ученым и аспирантам, осуществляющим перспективные научные исследования и разработки по приоритетным направлениям модернизации российской экономики «Исследование механизмов аритмогенеза и выявления мишеней для фармакологической коррекции аритмий при острой сердечной недостаточности в компьютерной модели миокарда человека» 2021-2022 гг. (Курсанов А.Г.)
- 18-29-13008, РФФИ "Суперкомпьютерное моделирование структурно-функциональных изменений в сердце при миокардиальном фиброзе для изучения механизмов сердечных аритмий с целью их диагностики и терапии", 2018-2021 гг. (рук. Панфилов А.В.)
- 18-01-00059, РФФИ "Математическое моделирование электромеханического сопряжения в клетках сердечной мышцы человека", 2018-2020 гг. (рук. Кацнельсон Л.Б.)
- 18-015-00368, РФФИ "Интегративные механизмы возрастных изменений электромеханической функции сердечных клеток", 2018-2020 гг. (рук. Соловьева О.Э.)
- 18-31-00416, РФФИ «Исследование механизмов регуляции электромеханической функции кардиомиоцитов в биомеханической модели неоднородного миокарда» 2018-2020 гг. (рук. Курсанов А.Г.)
- 16-34-60223, РФФИ «Математическое моделирование кальций-высвобождающей системы в сердечных клетках» 2016-2019 гг. (рук. Рывкин А.М.)
- 14-35-00005, РНФ "Персонифицированные математические модели в кардиологии", 2014-2016 гг. (рук. Мархасин В.С., Соловьева О.Э.)
- 14-01-00885, РФФИ "Интрамиокардиальные механические взаимодействия и ауторегуляция сократительной функции сердечной мышцы", 2014-2016 гг. (рук. Соловьева О.Э.)
- 0401-2015-0025, Программа № I.33П фундаментальных исследований Президиума РАН по стратегическим направлениям развития науки "Фундаментальные проблемы математического моделирования. Фундаментальные проблемы факторизационных методов в различных областях. Алгоритмы и математическое обеспечение для вычислительных систем сверхвысокой производительности". Часть "Фундаментальные проблемы математического моделирования". "Разработка вычислительных методов и программных средств для трехмерного моделирования сердечно-сосудистой системы", 2014-2017 гг. (рук. Соловьева О.Э.)
- 18-7-4-15, Комплексная программа УрО РАН "Математическое моделирование механоэлектрических обратных связей в кардиомиоците человека с учетом модифицированной концепции кооперативности регуляторных и сократительных белков" 2017-2019 гг. (рук. Кацнельсон Л.Б.)
- Программа Президиума РАН №27 «Фундаментальные проблемы решения сложных практических задач с помощью суперкомпьютеров». Проект «Персонификация цифровых моделей сердца человека с помощью суперкомпьютеров в целях персонифицированного прогноза, профилактики и лечения сердечно-сосудистых заболеваний, 2018-2020 гг. (рук. Соловьева О.Э.)
- 14-04-31151, РФФИ "Функциональная геометрия сердца при дилатационной кардиомиопатии, ресинхронизационной терапии, трансплантации сердца" 2014-2015 гг. (рук. Чумарная Т.В.)
- 13-04-00365, РФФИ "Механозависимость кальциевой активации сокращений миокарда. Концептуальные противоречия и подход к их разрешению в математической модели и в эксперименте", 2013 - 2015 гг. (рук. Кацнельсон Л.Б.)