Информация о материале

Uncategorised

13 декабря 2019

Просмотров: 6014

Проект «Разработка гибридного метода биофизического моделирования электромеханической функции миокарда и машинного обучения для повышения эффективности диагностики и лечения хронической сердечной недостаточности» поддержан Российским научным фондом (РНФ).

Руководитель проекта: Соловьева О.Э., д.ф.-м.н, директор ИИФ УрО РАН.

В проекте участвуют сотрудники Института иммунологии и физиологии УрО РАН, аспиранты и студенты ИИФ УрО РАН и УрФУ:

• Чумарная Т.В., к.б.н., с.н.с.;
• Хамзин С.Ю., аспирант, м.н.с.;
• Докучаев А.Д., м.н.с.;
• Бажутина А.Е., магистрант, м.н.с.;
• Мангилева Д.В., магистрант, м.н.с.

Проект выполняется совместно с кардиологами и аритмологами ФГБУ "Национальный научный центр им. Алмазова" (г. Санкт-Петербург) из группы профессора РАН Лебедева Д.С., д.м.н.:

• Любимцева Т.А., к.м.н;
• Лебедева В.К.,д.м.н;
• Зубарев С.В.,к.м.н.

Коллектив проекта сотрудничает с ведущими специалистами ФГБУ "Свердловская областная клиническая больница" (г. Екатеринбург) и Уральского государственного медицинского института.

Настоящий проект направлен на разработку методов построения и использования вычислительных и информационных моделей для оценки эффективности сердечной ресинхронизирующей терапии (СРТ) для пациентов с хронической сердечной недостаточностью (ХСН) различной этиологии, резистентных к медикаментозной терапии и имеющих электрическую сердечную диссинхронию.

ХСН является одной из ведущих причин смерти во всем мире, несмотря на оптимальное лечение. Разработка новых методов лечения ХСН является сложной задачей и может быть значительно ускорена с помощью интеллектуального моделирования. Для продвижения вычислительных моделей в клинику требуется развивать новые комбинированные подходы к моделированию сердца, сочетающие возможности популяционного моделирования и персонификации моделей на основе клинических данных с современными методами анализа и машинного обучения.

Основной целью применения моделирования для анализа клинических данных пациента является объективная оценка сократимости миокарда и определение его собственного сократительного резерва, необходимого для увеличения насосной функции сердца при синхронизации возбуждения желудочков. Решение этой задачи позволит увеличить точность прогноза потенциального результата СРТ и снизит долю пациентов, не отвечающих на терапию.

Другой важной клинической задачей является выбор оптимальных параметров процедуры СРТ для конкретного пациента, которую также можно более обоснованно решать с учетом дооперационного персонифицированного компьютерного моделирования при различных режимах стимуляции желудочков сердца.

С практической точки зрения, данное исследование должно ответить на вопрос о возможности улучшения функции конкретного сердца в результате ресинхронизации возбуждения желудочков и оптимизации процедуры СРТ за счет выбора расположения стимулирующих электродов, вектора стимуляции и задержки стимуляции.

Краткий отчет за 2019 год и список опубликованных работ по проекту можно увидеть на сайте РНФ

 https://rscf.ru/contests/search-projects/19-14-00134/

Вести Урал представили материал о работе коллектива по проекту:
КОМПЬЮТЕРНУЮ МОДЕЛЬ СЕРДЕЧНОЙ МЫШЦЫ ПРЕЗЕНТОВАЛИ УРАЛЬСКИЕ УЧЁНЫЕ

Информация о материале

Uncategorised

13 декабря 2019

Просмотров: 3074

Проект 21-14-00226 «Аритмогенная роль пограничной зоны миокарда при ишемии и реперфузии сердца: in vivo, in vitro, in silico» поддержан Российским научным фондом (РНФ).
(Конкурс Российского научного фонда 2021 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»)

Руководитель проекта: Кацнельсон Л.Б., д.ф.-м.н, ведущий научный сотрудник лаборатории математической физиологии ИИФ УрО РАН.

В проекте участвуют сотрудники Института иммунологии и физиологии УрО РАН, аспиранты ИИФ УрО РАН и УрФУ:

• Балакина-Викулова Н.А., к.ф.-м.н., с.н.с.;
• Курсанов А.Г., к.ф.-м.н., с.н.с.;
• Рокеах Р.О., аспирант, м.н.с.;
• Мангилева Д.В., аспирант, м.н.с.

Проект выполняется совместно с сотрудниками Института физиологии ФИЦ Коми НЦ УрО РАН, Республика Коми из группы д.б.н. Азарова Я.Э.:

• Берникова О.Г., к.м.н., с.н.с.;
• Овечкин А.О., к.м.н., с.н.с.;
• Груббэ М.Е., ст. лаб.;
• Комаров И.А., ст. лаб.

Желудочковая тахикардия и фибрилляция желудочков, являясь частым осложнением инфаркта миокарда, вызывают серьёзные, часто жизнеугрожающие нарушения гемодинамики. Прогноз и профилактика таких аритмий составляют важную исследовательскую задачу. При ишемии миокарда создаются сразу несколько условий, предрасполагающих к возникновению желудочковой тахикардии и/или фибрилляции желудочков (невозбудимый участок миокарда, неоднородность реполяризации, замедление проведения), что сильно затрудняет лечение и профилактику аритмий.

При ведении пациентов с инфарктом миокарда отдельную проблему составляет недоступность поражённой области для лекарственных средств, доставляемых с кровотоком, поскольку кровоснабжение этого участка полностью или частично блокировано. В то же время перфузируемый миокард представляет собой вполне достижимую мишень. В пределах перфузируемого миокарда выделяется так называемая пограничная зона, находящаяся между нормальной и ишемизированной областями. Пограничная зона может служить и субстратом, и источником пусковых импульсов для возникновения и поддержания жизнеугрожающих аритмий. В настоящем проекте мы представляем идею, базирующуюся на наших предыдущих экспериментальных, модельных и клинических исследованиях и заключающуюся в том, что воздействия на перфузируемую область могут положительно повлиять на характеристики пограничной зоны и подавить аритмогенные процессы в сердце.

Физиологические изменения в пограничной зоне определяются взаимодействием между нормальной и поражённой областями, а также рядом «внешних» факторов, таких как частота сердечных сокращений, системная гемодинамика, электролитный баланс и др. Взаимодействие многих факторов приводит к изменениям электрофизиологических свойств по нескольким сценариям, часть из которых может быть аритмогенно-опасной. В рамках настоящего проекта мы предполагаем решить три основные задачи: установить механизмы проаритмических изменений в пограничной зоне, выявить данные изменения на ЭКГ и предложить метод компенсации этих изменений для снижения риска аритмий.
Достижение вышеназванных целей требует комбинации экспериментального подхода и математического моделирования и соответственно сотрудничества двух групп исследователей. Реализация данного проекта будет основана на двустороннем обмене данных, получаемых в ходе экспериментов и моделирования. Экспериментально мы будем исследовать электрофизиологические и механические свойства миокарда in vivo на экспериментальных моделях острой ишемии-реперфузии сердца крыс и свиней и in vitro на изолированных кардиомиоцитах. Мы будем прослеживать изменения в пограничной области от электрофизиологических характеристик сердца до их проявлений на ЭКГ от поверхности тела и встречаемости аритмий. Также мы отследим эти изменения в обратном направлении – от сердца до экспрессии белков и ионных токов, порождающих эти изменения в пограничной области.

В математических моделях электромеханического сопряжения в кардиомиоцитах, в многоклеточных препаратах и в желудочках будет проанализирован вклад тех или иных внутриклеточных механизмов и механизмов межклеточного электрического и механического взаимодействия в исследуемые нарушения ритма. Кроме того, с помощью этих моделей будут «разыграны» различные возможные сценарии развития фибрилляции желудочков, подлежащие последующей экспериментальной проверке. В численных экспериментах с этими моделями будут предложены методы коррекции и профилактики фибрилляций желудочков, которые затем также могут быть проверены в экспериментах in vivo и in vitro.

В результате выполнения данного проекта мы намерены установить неизвестные в настоящее время механизмы, определяющие роль пограничной зоны в нарушениях ритма при ишемии, и предложить новые способы профилактики аритмий.

Результаты, полученные в рамках проекта в 2022 году опубликованы в научном микроблоге на сайте института.

Информация о материале

Uncategorised

04 октября 2019

Просмотров: 6486

На данной странице доступны следующие документы и бланки Этического комитета ИИФ УрО РАН.

• Приказ о создании этического комитета (скачать PDF).
• Положение о этическом комитете ИИФ УрО РАН (скачать PDF).
• Регламент работы Этического комитета ИИФ УрО РАН (скачать DOC).
• Образец письма-заявки в Этический комитет ИИФ УрО РАН (скачать DOC).

Информация о материале

Uncategorised

07 мая 2019

Просмотров: 6793

• Устав ИИФ УрО РАН от 6 июля 2018 г. (скачать PDF)
• Изменения в устав ИИФ УрО РАН от 27 декабря 2018 г. (скачать PDF)
• Приказ о назначении на должность директора ИИФ УрО РАН (скачать PDF)

Информация о материале

Uncategorised

07 мая 2019

Просмотров: 6142

УВЕДОМЛЕНИЕ ОК ТЕИ (Скачать PDF).

Свидетельство ОГРН (Скачать PDF)

Информация о материале

Uncategorised

17 апреля 2019

Просмотров: 45531

Информация в процессе подготовки.

Информация о материале

Uncategorised

20 сентября 2017

Просмотров: 7468

	Фамилия Имя Отчество	Должность, ученая степень и звание	ORCID, ключевые слова	Телефон рабочий	E-mail
	Соловьева Ольга Эдуардовна	зав. лаб., д.ф.-м.н. профессор	биофизика, физиология сердца, математическое моделирование, кардиология, прикладная математика, вычислительная физиология, компьютерная математика, математическая биология	+7(343) 374-00-70	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Кацнельсон Леонид Борисович	вед.н.с. д.ф.-м.н.	биофизика мышечных сокращений, биомеханика миокарда, электромеханическое сопряжение и механо-электрические обратные связи в сердечной мышце, математическое моделирование	+7(343) 362-34-65	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Балакина-Викулова Наталия Алексеевна	ст.н.с., к.ф.-м.н.	математические модели сердечной мышцы; электромеханическое сопряжение и механоэлектрические обратные связи в сердце	+7(343) 362-34-77	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Коновалов Павел Владимирович	ст.н.с., к.б.н.	возбудимые среды, спиральная волна; трехмерные вихри; сердечная мышца; связь возбуждения-сокращения; электромеханическая математическая модель; механоэлектрическая обратная связь	+7(343) 362-34-77	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Курсанов Александр Геннадьевич	ст.н.с., к.ф.-м.н.	биофизические модели сердечной мышцы, электромеханическое сопряжение в сердечной ткани, межклеточное взаимодействие в миокарде	+7(343) 362-34-41	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Чумарная Татьяна Владиславовна	ст.н.с., к.б.н.	Клинико-физиологические исследования сердца, эхокардиография, функциональная геометрия левого желудочка сердца, информационные модели прогноза, биостатистика	+7(343) 362-34-41	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Мангилева Дарья Владимировна	м.н.с.	математическое моделирование, 3D модели сердца, обработка изображений	+7(343) 362-00-61	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Нестерова Татьяна Михайловна	м.н.с.,	модели электрофизиологии кардиомиоцитов, популяции моделей, старение, кардиомиоциты предсердий, хроническая фибрилляция предсердий, дофетилид	+7(343) 362-00-61	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.

Исследования лаборатории математической физиологии ИИФ УрО РАН выполняются в рамках государственного задания по теме: "Экспериментальное и теоретическое исследование интеграции механизмов регуляции функции сердечной мышцы от молекул до органа в норме и при патологии" (Регистрационный номер НИОКТР №АААА-А18-118020590031-8), 2013-2021 гг.

• математическое моделирование электромеханического сопряжения в неоднородном миокарде на клеточном, тканевом и органном уровне с учетом механо-электрических, механо-кальциевых и механо-метаболических обратных связей (одномерные, двумерные, трехмерные модели миокардиальной ткани);
• математическое моделирование нарушений сократительной функции миокарда при различных патологиях сердца, в т.ч. при ишемии, инфаркте и сердечной недостаточности;
  • математическое моделирование функции сердца при возрастных изменениях;
• популяционное моделирование изменений электрической активности кардиомиоцитов предсердия, вызванных старением, хронической фибрилляцией предсердий и действующими веществами (дофетилидом).
• исследование механизмов регуляции кальцием вызванного высвобождения кальция в рамках биофизических моделей суб-клеточного и клеточного уровня;
• клинико-физиологическое исследование функции сердца в норме, при сердечно-сосудистой патологии с различной степенью выраженности нарушений электрической и сократительной функции и геометрического ремоделирования сердца.

Важнейшие результаты

Разработаны математические модели сократительной функции миокарда на разных уровнях его организации: от клетки до целого желудочка.

Совместно с коллегами из лаборатории электрофизиологии Д. Нобла из Оксфордского Университета разработана модель «Екатеринбург-Оксфорд» электромеханического сопряжения (ЭМС) в кардиомиоцитах (Sulman ea, Bul. Math. Biol, 2008). Ключевым элементом модели являются механизмы кооперативности регуляторных и сократительных белков, объясняющие широкий спектр механо-электрических и механо-кальциевых обратных связей в миокарде. Эта модель использована для анализа нарушений сердечного ритма и механической функции при перегрузке кардиомиоцитов кальцием (Sulman ea, Bul. Math. Biol, 2008; Katsnelson ea, J. Theor. Biol. 2011).

Модификации, внесённые в рамках математических моделей в концепцию кооперативности регуляторных и сократительных белков, позволили снять противоречия, имевшиеся между проявлениями этой кооперативности в экспериментах на интактных препаратах миокарда, с одной стороны, и скинированной сердечной мышц, с другой (Shikhaleva ea, Computing in Cardiology, 2015; Докучаев и др., Биофизика, 2016).

Одним из важных результатов исследований последних лет было создание видоспецифических моделей кардиомиоцитов и миокардиального волокна на основе переработанной модели "Екатеринбург-Оксфорд" - например, модели ЭМС в эндо- и эпи- клетках левого желудочка морской свинки (Khokhlova ea, J.Physiol. Sci., 2017), в кардиомиоцитах крысы (Katsnelson ea, Comp in Cardiol, 2018) и человека (Balakina-Vikulova ea, J Physiol Sciences. 2020). В 2018-2020 гг. были опубликованы новые результаты экспериментально-теоретического исследования, проведённого в сотрудничестве с физиологами, изучающими механо-кальциевые обратные связи на изолированных кардиомиоцитах мышей, и посвящённого трансмуральной неоднородности кардиомиоцитов в стенке желудочка (Khokhlova ea, J Mol Cell Cardiol, 2018, Khokhlova ea, Frontiers in Physiol, 2020).

С использованием методов популяционного моделирования исследовано влияние старения на электрическую функцию кардиомиоцитов предсердия (Nesterova ea, Bio Web Conf, 2020). В построенных популяциях математических моделей воспроизводятся экспериментальные данные по возрастному изменению амплитуды, уровня плато и длительности потенциала действия, амплитуды кальциевого перехода. Проведённое моделирование воздействия на данные популяции антиаритмического препарата III класса — дофетилида показало, что чувствительность к дофетилиду у здоровых людей с возрастом снижается. Разработаны модели, описывающие особенности ионной динамики и процессов генерации потенциала действия в клетках водителя сердечного ритма при старении, а также в онтогенезе (Markov& Ryvkin, USBEREIT, 2019).

На основе клеточных моделей построены модели механической и электрической активности многоклеточного миокарда на разных уровнях: от одиночного волокна (Vikulova ea, J. Math. Biol., 2016; Khokhlova ea, Comp. in Biol. Medicine, 2017) - до целого левого желудочка (ЛЖ) (Pravdin ea, PLoS ONE, 2014; Pravdin ea, Mathematics. 2020).
Разработаны модели динамики ионов кальция в сердечных клетках, учитывающие сложную структуру внутриклеточной кальций-высвобождающей системы, позволяющие детально описать процессы, связанные с процессами высвобождения кальция в сердечных клетках (Markov& Ryvkin, USBEREIT, 2020).

Впервые проведена оценка количественных показателей пространственно-временной неоднородности кинетики стенки левого желудочка сердца и описаны динамические изменения индексов формы левого желудочка во время сердечного цикла в норме и при разных видах сердечно-сосудистой патологии, в частности при ишемической болезни сердца, дилатационной кардиомиопатии, при ортотопической трансплантации сердца, позволившие сформулировать представление о новой физиологической характеристике – функциональной геометрии сердца. Проведена оценка показателей функциональной геометрии сердца в онтогенезе.

Научное сотрудничество

• Department of Physiology, Anatomy and Genetics, University of Oxford, UK;
• The Institute for Experimental Cardiovascular Medicine, Freiburg, Germany;
• Ghent University, Department of Physics and Astronomy, Belgium;
• Thomas J. Watson Research Center, IBM, USA;
• Okayama University, Japan; Asahikawa Medical University, Department of Physiology, Japan;
• École Polytechnique, France;
• Уральский федеральный университет им. первого Президента РФ Б.Н. Ельцина, Научная лаборатория ”Математическое моделирование в физиологии и медицине с использованием суперкомпьютерных технологий”, Екатеринбург;
• Областная клиническая больница (ОКБ) №1, Екатеринбург;
• Уральский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения РФ, Екатеринбург;
• Уральский научно-исследовательский институт охраны материнства и младенчества МЗ РФ, Екатеринбург;
• Национальный медицинский исследовательский центр им. В.А. Алмазова, Санкт-Петербург;
• Институт математики и механики РАН, Екатеринбург;
• Институт механики МГУ, Москва;
• Научный центр сердечно-сосудистой хирургии им. А.Н. Бакулева Российской академии медицинских наук, Москва;
• Институт физиологии Коми НЦ, Сыктывкар;
• Суперкомпьютер «УРАН» ИММ УрО РАН;
• Вычислительный кластер УрФУ.

Информация о материале

Uncategorised

20 сентября 2017

Просмотров: 5251

Национальный проект "Наука и университеты" в ИИФ УрО РАН

Национальный проект «Наука и университеты» реализуется согласно указам Президента Российской Федерации от 7 мая 2018 г. № 204 «О национальных целях и стратегических задачах развития Российской Федерации на период до 2024 года» и от 21 июля 2020 г. № 474 «О национальных целях развития Российской Федерации на период до 2030 года». Его ключевая задача — воспитание и поддержка нового поколения ученых. В рамках нацпроекта «Наука и университеты» выделяются значительные средства на поддержку ученых и создание научных центров с первоклассными условиями для исследовательской работы. 

В рамках национального проекта в Институте иммунологии и физиологии УрО РАН в 2019 году была создана Лаборатория трансляционной медицины и биоинформатики.

Заведующий лабораторией – Щепкин Даниил Владимирович, к.б.н.

Тел. (343) 374-08-39, доб. 133
E-mail:  Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.

	Фамилия Имя Отчество	Должность, ученая степень и звание	ORCID, ключевые слова	Телефон рабочий	E-mail
	Щепкин Даниил Владимирович	Старший научный сотрудник, заведующий лабораторией, к.б.н.	кардиомиоцит, тропомиозин, миозин связывающий белок С	+7 (343) 374-00-70	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Хохлова Анастасия Дмитриевна	Старший научный сотрудник, к.ф.-м.н., доцент	кардиомиоцит, неоднородность миокарда, биомеханика	+7 (343) 374-08-39, доб. 133	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Герцен Оксана Павловна	научный сотрудник, к.б.н.	миокард, актин-миозиновое взаимодействие, кардиотоксичность, физическая нагрузка	8(343)	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Хамзин Святослав Юрьевич	научный сотрудник	электрофизиология сердца, машинное обучение		Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Докучаев Арсений Дмитриевич	научный сотрудник,	электрофизиология сердца, машинное обучение, персонифицированное моделирование		Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Байкенова Мадина Багатчановна	Младший научный сотрудник,	сахарный диабет, ожирение, печень, инсулин-позитивные клетки		Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Белоусова Анна Викторовна	Младший научный сотрудник,			@iip.uran.ru
	Бельдия Евгения Александровна	Лаборант-исследователь	миокард, актин-миозиновое взаимодействие, кальциевая регуляция, in vitro подвижная система		@iip.uran.ru
	Бутова Ксения Андреевна	Младший научный сотрудник	биофизика миокарда, кардиомиоцит, неоднородность миокарда, фибрилляция предсердий	8(343) 374-08-39, доб. 133	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Волжанинов Денис Александрович	Младший научный сотрудник	кардиомиоцит, биомеханика, биоинженерия	8(343) 374-75-24 (доб. 132)	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Кочурова Анастасия Михайловна	Младший научный сотрудник	миокард, актин-миозиновое взаимодействие, кальциевая регуляция, in vitro подвижная система, сердечная недостаточность, сахарный диабет		Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Мячина Татьяна Анатольевна	Младший научный сотрудник	кардиомицит, предсердия и желудочки, электромеханическое сопряжение, внутриклеточная неоднородность, сахарный диабет, гипоэстрогения	8(343) 374-08-39, доб. 133	Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Симонова Раиса	биолог-исследователь	биофизика миокарда, кардиомиоцит, неоднородность миокарда		@iip.uran.ru
	Ушенин Константин Сергеевич	Младший научный сотрудник	электрофизиология сердца, машинное обучение, персонифицированное моделирование, биоинформатика		Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
	Демичева Екатерина Ивановна	математик-исследователь	биоинформатика, сердечно-сосудистые заболевания		Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.

Молодые ученые о лаборатории
Лаборатория трансляционной медицины и биоинформатики (ЛТМиБ) прогрессивно развивается и интенсивно эволюционирует с 2019 года. ЛТМиБ собрала под своим крылом молодых учёных самых разных направлений – биологов, физиков, химиков, математиков и, возможно, это ещё не полный перечень!

Что же объединяет эти юные умы? Гос. задание Института? Да, это так. Но ещё их объединяет боевой настрой, неутолимая кофеином жажда знаний в глазах и неугомонное стремление трудиться во благо науки круглые сутки!

Искренняя любовь молодых ученых к науке, желание – и даже страсть – узнать истину и понять систему на разных уровнях организации оставляет неизгладимое впечатление! А крысы прячутся при виде их горящих (с одобрения комиссии по биоэтике) взглядов!

Трансляционная медицина и биоинформатика – это новые и невероятно актуальные направления науки, поэтому, мы верим, что ЛТМиБ семимильными шагами приближает светлое будущее персонифицированной (и не только) медицины.

Авторы: Оксана П. Герцен и Ксения А. Бутова 

Основные направления исследований

• особенности регуляции механической функции кардиомиоцитов и актин-миозинового взаимодействия в различных отделах сердца в норме и при патологии
• исследование молекулярно-клеточных механизмов нарушения механической активности предсердий и желудочков при сердечной недостаточности
• исследование влияния интоксикации солями и наночастицами свинца и/или кадмия на механическую функцию миокарда на молекулярном уровне и поиск способов коррекции
• исследование влияния фармакологических модуляторов на механическую функцию кардиомиоцитов и сократительных белков саркомера в различных регионах сердца
• внепанкреатические инсулин-продуцирующие системы при моделировании сахарного диабета 1 и 2 типа и его коррекции
• тучные клетки в мужской репродуктивной системе и их влияние на сперматогенез
• использование машинного обучения и методов биоинформатики для автоматической обработки медико-биологических данных

1. С использованием уникальных методик регистрации взаимодействия сократительных белков исследовано нарушение функции сократительных белков миокарда при интоксикации солями тяжелых металлов (свинец, кадмий).
2. Изучено влияние фармацевтического активатора сердечного миозина CK-1827452, омекамтив мекарбила, на кальциевую регуляцию актин-миозинового взаимодействия и сократительную активность кардиомиоцитов предсердий и желудочков.
3. Разработаны и усовершенствованы методы экспериментальные исследования активности изолированных кардиомиоцитов в норме и при патологии различного генеза. Предложен новый метод выделения жизнеспособных одиночных кардиомиоцитов из сердечной ткани. Разработан новый метод оценки сократительной активности, динамики внутриклеточного Са2+ и распределения t-тубулярной системы в различных регионах одиночного кардиомиоцита
4. Для изучения пассивных вязкоупругих и активных сократительных свойств интактных одиночных кардиомиоцитов разработаны биомеханические протоколы с использованием методики четырёх карбоновых волокон, реализуемой с помощью системы цифрового манипулирования
5. Исследованы межкамерные различия сократительной функции одиночных кардиомиоцитов и сократительных белков саркомера при экспериментальном сахарном диабете у крыс.
6. Проведены исследования механизмов патогенеза ряда социально-значимых заболеваний на экспериментальных моделях у животных. Исследованы особенности инсулин-позитивных клеток в печени здоровых животных и при экспериментальном сахарном диабете у крыс.
7. Разработаны экспериментальные модели таких социально-значимых заболеваний, как хроническая обструктивная болезнь легких и фибрилляция предсердий у крыс.
8. Разработаны новые подходы использования нейронных сетей и регрессионного анализа для автоматической обработки данных, полученных при гистологических исследованиях, а также различными инструментальными методами исследований.

Проекты, гранты

Текущие проекты:

1. РНФ № 18-74-10059 «Исследование молекулярно-клеточных механизмов нарушения механической активности миокарда предсердий и желудочков при сердечной недостаточности» (руководитель: Хохлова А.Д., исполнители: Мячина Т.А., Волжанинов Д.А., Берг В.Ю.)
2. РНФ 21-15-00169 «Ремоделирование структуры и функции правого предсердия и желудочка при легочно-сердечной недостаточности» (руководитель: Проценко Ю.Л., исполнители: Бутова К.А., Герцен О.П.)
3. РФФИ № 20-315-70006 «Исследование влияния локальной продукции эстрадиола жировой тканью сердца на электромеханическое сопряжение в миокарде желудочков и предсердий» (руководитель: Хохлова А.Д., исполнители: Мячина Т.А., Бутова К.А., Волжанинов Д.А., Берг В.Ю.)
4. РФФИ № 21-54-15001 НЦНИ_а «Внутриклеточная неоднородность электромеханического сопряжения в миокарде» (руководитель: Лукин О.Н., исполнители: Хохлова А.Д., Мячина Т.А., Бутова К.А.)
5. РФФИ 20-31-90106 аспиранты «Исследование межжелудочковых особенностей длинозависимой и грузозависимой регуляции механической функции одиночных кардиомиоцитов» (руководитель: Соловьева О.Э, исполнитель: Волжанинов Д.А.)

Завершенные проекты:

1. РНФ № 22-74-00128 «Исследование молекулярных механизмов прямого влияния ионов свинца и кадмия на механическую функцию миокарда» (руководитель: к.б.н. Герцен О.П.).
2. РНФ № 16-15-00039 (2018-2020) «Поиск средств фармакологической коррекции регенераторных процессов при экспериментальном моделировании сахарного диабета» (руководитель: Данилова И.Г., исполнитель: Байкенова М.Б.)
3. MK-949.2019.4 (2019-2020) «Исследование влияния механической нагрузки на сократительную функцию одиночных кардиомиоцитов предсердий и желудочков» (руководитель: Хохлова А.Д., исполнители: Мячина Т.А., Бутова К.А., Волжанинов Д.А.)
4. РФФИ № 20-04-00130 «Исследование влияния мутаций в гене TPM1, ассоциированных с врожденными заболеваниями сердца, на структурные и функциональные характеристики альфа- и каппа-изоформ тропомиозина» (руководитель: Бершицкий С.Ю., исполнитель: Кочурова А.М.)
5. РФФИ № 18-04-00572 «Инактивирующий эффект систолического укорочения и метод его оценки при определении сократительного потенциала миокарда» (руководитель: Лукин О.Н., исполнитель: Бутова К.А.)
6. РФФИ № 18-015-00252 А «Роль модуляции функции изоформ сердечного миозина в механизме кальциевой регуляции актин-миозинового взаимодействия в норме и при патологии» (руководитель: Бершицкий С.Ю., исполнитель: Берг В.Ю.)
7. РФФИ (КОМФИ) № 17-00-00070 (2017-2019) «Экспериментальное исследование влияния фосфорилирования тропомиозина, несущего кардиомиопатические мутации, на функциональные характеристики актин-миозинового взаимодействия в миокарде» (руководитель: Бершицкий С.Ю., исполнитель: Берг В.Ю.)

Информация о материале

Uncategorised

01 апреля 2015

Просмотров: 6902

2024

• Abramochkin D.A., Pustovit O.B., Mironov N.Yu., Filatova T.S., Nesterova T. Characterization of hERG K channel inhibition by the new class III antiarrhythmic drug cavutilide // Naunyn-Schmiedeberg's Archives of Pharmacology. 2024. V. 397, p. 5093–5104.
  doi: 1007/s00210-023-02940-5
  IF(2023)=3.1, Q2
• Demicheva E., Dordiuk V., Polanco Espino F., Ushenin K., Aboushanab S., Shevyrin V., Buhler A., Mukhlynina E., Solovyova O., Danilova I., Kovaleva E. Advances in Mass Spectrometry-Based Blood Metabolomics Profiling for Non-Cancer Diseases: A Comprehensive Review // Metabolites. 2024. V. 14, 54.
  doi: 3390/metabo14010054
  IF(2023)=3.3, Q2
• Abramochkin D., Li B., Zhang H., Kravchuk E., Nesterova T., Glukhov G., Shestak A., Zaklyazminskaya E., Sokolova O. S. Novel Gain-of-Function Mutation in the Kv11. 1 Channel Found in Patient with Brugada Syndrome and Mild QTc Shortening // Biochemistry-Moscow, 2024, V. 89, pp. 543–552.
  doi: 1134/S000629792403012X
  IF(2023)=2.3, Q3
• Mangileva D., Grubbe M., Kursanov A., Bernikova O., Tsvetkova A., Ovechkin A., Azarov J., Katsnelson L., Solovyova O. Deformation Velocity in the Porcine Ventricular Epicardium during Acute Ischemia in In Situ Experiments // 2024 IEEE Ural-Siberian Conference on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology (USBEREIT), Yekaterinburg, Russian Federation, 2024, pp. 296-299.
  doi: 1109/USBEREIT61901.2024.10584018
  Scopus
• Медведь М.С., Зубарев С.В., Чумарная Т.В., Бажутина А.Е., Соловьева О.Э., Лебедев Д.С. Неинвазивное активационное картирование при постоянной электрокардиостимуляции проводящей системы сердца // Вестник аритмологии. 2024.V. 31(1), p. 47-52.
  doi: 10.35336/VA-1251
  Scopus
• Павличенко М.В., Косовцова Н.В., Чумарная Т.В., Черемохин Д.А., Болков М.А., Соловьева О.Э. Анализ уровней TREС и KREC у недоношенных монохориальных диамниотических близнецов с учетом специфических осложнений антенатального периода // Неонатология: новости, мнения, обучение. 2024. Т. 12. № 2 (44). С. 29-43. 
  doi:10.33029/2308-2402-2024-12-2-29-43
  РИНЦ

ПАТЕНТЫ и другие РИД

• Cardiac rhythmogram compression for detection of atrial fibrillation // Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ. № 2024618859. Дата государственной регистрации в Реестре программ для ЭВМ 17 апреля 2024 г. Авторы Марков Н.С., Соловьева О.Э. Правообладатели: ИИФ УрО РАН.

2023

• Nesterova T, Rokeakh R, Solovyova O, Panfilov A. Mathematical Modelling of Leptin-Induced Effects on Electrophysiological Properties of Rat Cardiomyocytes and Cardiac Arrhythmias // Mathematics. 2023. V. 11(4), 874.
  doi: 3390/math11040874
  IF (2022)=2.4, Q1
• Kursanov A., Balakina-Vikulova N.A., Solovyova O., Panfilov A., Katsnelson L.B. In silico analysis of the contribution of cardiomyocyte-fibroblast electromechanical interaction to the arrhythmia // Frontiers in Physiology. 2023. V. 14. 1123609.
  doi: 3389/fphys.2023.1123609
  IF (2022)=4, Q2
• Dokuchaev A., Kursanov A., Balakina-Vikulova N.A., Katsnelson L., Solovyova O. The importance of mechanical conditions in the testing of excitation abnormalities in a population of electro-mechanical models of human ventricular cardiomyocytes // Frontiers in Physiology. 2023. V. 14. 1187956.
  doi: 3389/fphys.2023.1187956
  IF (2022)=4, Q2
• Dokuchaev A., Chumarnaya T., Bazhutina A., Khamzin S., Lebedeva V., Lyubimtseva T., Zubarev S., Lebedev D., Solovyova O. Optimization of left ventricular pacing site in cardiac resynchronization therapy using combination of personalized computational modeling and machine-learning // Frontiers in Physiology. 2023. V.14. 1162520.
  doi: 3389/fphys.2023.1162520
  IF (2022)=4, Q2
• Башмакова Н.В., Севостьянова О.Ю., Чумарная Т.В., Обоскалова Т.А. Распространенность доброкачественной дисплазии молочной железы в Уральском федеральном округе // Акушерство и гинекология. Т. 8. с. 103-110.
  doi: 10.18565/aig.2023.131
  Scopus, РИНЦ
• Маркова Т.В., Косовцова Н.В., Шумаков С.Ю., Чумарная Т.В., Ермак Е.М., Поспелова Я.Ю. Роль ультразвуковых маркеров I триместра в прогнозировании синдрома фето-фетальной трансфузии при монохориальном многоплодии // РМЖ. Мать и дитя. 2023. Т. 6(3). с. 226–232.
  doi: 32364/2618-8430-2023-6-3-2
• Rokeakh R., Chumarnaya T., Zubarev S., Lebedev D., Solovyova O. Statistical shape analysis reveals specific features of left ventricular wall motion in patients with chronic heart failure // 2023 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), Novosibirsk, Russian Federation. p. 231-235.
  doi: 1109/CSGB60362.2023.10329847
  Scopus
• Markov N., Ushenin K., Bozhko Ya., Solovyova O. Compressor-based classification for atrial fibrillation detection // 2023 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), Novosibirsk, Russian Federation. p. 122-127.
  doi: 1109/CSGB60362.2023.10329826
  Scopus
• Bazhutina A., Ushenin K., Khamzin S., Kabak V., Zubarev S., Lebedev D., Solovyova O. Personalized cardiac computer models and machine-learning for target vein selection in cardiac resynchronisation therapy // 2023 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), Novosibirsk, Russian Federation. p. 236-241.
  doi: 1109/CSGB60362.2023.10329851
  Scopus
• Kursanov A., Balakina-Vikulova N., Katsnelson L. Block of electrical excitation during the development of ischemia in the mathematical model of the fiber // 2023 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), Novosibirsk, Russian Federation. p.  255-258.
  doi: 10.1109/CSGB60362.2023.10329857
  Scopus
• Башмакова Н.В., Севостьянова О.Ю., Чумарная Т.В., Обоскалова Т.А. Распространенность доброкачественной дисплазии молочной железы в Уральском федеральном округе // Акушерство и гинекология. 2023. Т. 8. с. 103-110.
  doi: 18565/aig.2023.131
  Scopus, РИНЦ
• Маркова Т.В., Косовцова Н.В., Шумаков С.Ю., Чумарная Т.В., Ермак Е.М., Поспелова Я.Ю. Роль ультразвуковых маркеров I триместра в прогнозировании синдрома фето-фетальной трансфузии при монохориальном многоплодии // РМЖ. Мать и дитя. 2023. Т. 6(3). с. 226–232.
  doi: 32364/2618-8430-2023-6-3-2

ПАТЕНТЫ и другие РИД

• Способ прогнозирования эффективности электрокардиостимуляционной ресинхронизирующей терапии у больных с дилатационной кардиомиопатией в ранний послеоперационный период // Патент на изобретение № 2801127. Дата государственной регистрации в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 02 августа 2023 г. Авторы: Идов Э.М., Михайлов С.П., Алуева Ю.С., Шахмаева Н.Б., Соловьева О.Э., Чумарная Т.В. Правообладатели: СОКБ №1, ИИФ УрО РАН.

• Способ прогнозирования эффективности сердечной ресинхронизирующей терапии с использованием оптимизации расположения стимулирующих электродов // Патент на изобретение № 2806486. Дата государственной регистрации в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 01 ноября 2023 г. Авторы: Соловьева О.Э., Бажутина А.Е., Докучаев А.Д., Рокеах Р.О., Хамзин С.Ю., Чумарная Т.В., Зубарев С.В., Лебедева В.К., Лебедев Д.С., Любимцева Т.А. Правообладатели: ИИФ УрО РАН, НМИЦ им. В.А. Алмазова.

• LKLVS - Lukas Kanade Left Ventricle Segmentation // Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ. № 2023619715. Дата государственной регистрации в Реестре программ для ЭВМ 15 мая 2023. Авторы: Зюзин В.В., Чумарная Т.В., Рокеах Р.О., Бабаков В.О., Поршнев С.В., Соловьева О.Э. Правообладатели: УрФУ, ИИФ УрО РАН.

• LVFG - Left Ventricle Function Geometry // Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ. № 2023665251. Дата государственной регистрации в Реестре программ для ЭВМ 13 июля 2023 г. Авторы: Чумарная Т.В., Рокеах Р.О., Соловьева О.Э. Правообладатели: ИИФ УрО РАН.

• LVSSA - Left Ventricle Statistical Shape Analysis // Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ. № 2023680889. Дата государственной регистрации в Реестре программ для ЭВМ 20 октября 2023 г. Авторы: Рокеах Р.О. Правообладатели: ИИФ УрО РАН.

 2022

• Ryashko L., Bashkirtseva I., Solovyova O. Stochastic dynamics in the Li–Rinzel calcium oscillation model // Mathematical Methods in the Applied Sciences. V. 45(13), p. 7962-7970.
  doi: 1002/mma.7675
  IF (2021)=3.007, Q1
• Khokhlova A., Myachina T., Butova X., Kochurova A., Polyakova E., Galagudza M., Solovyova O., Kopylova G., Shchepkin D. The Acute Effects of Leptin on the Contractility of Isolated Rat Atrial and Ventricular Cardiomyocytes // International Journal of Molecular Sciences. 2022. V. 23, № 15. p. 8356.
  doi: 3390/ijms23158356
  IF (2021) = 6.208, Q1
• Karlova M., Abramochkin D. V., Pustovit K. B., Nesterova T., Novoseletsky V., Loussouarn G., Zaklyazminskaya E., Sokolova O. S. Disruption of a Conservative Motif in the C-Terminal Loop of the KCNQ1 Channel Causes LQT Syndrome // International Journal of Molecular Sciences. 2022. V. 23, № 14. p. 7953.
  doi: 3390/ijms23147953
  IF (2021) = 6.208, Q1
• Khokhlova A., Myachina T., Volzhaninov D., Butova X., Kochurova A., Berg V., Gette I., Moroz G., Klinova S., Minigalieva I., Solovyova O., Danilova I., Sokolova K., Kopylova G., Shchepkin D. Type 1 Diabetes Impairs Cardiomyocyte Contractility in the Left and Right Ventricular Free Walls but Preserves It in the Interventricular Septum // International Journal of Molecular Sciences. 2022. V. 23, № 3. P. 1719.
  doi: 3390/ijms23031719
  IF (2021) = 6.208, Q1
• Albors C., Lluch È., Gomez J.F., Cedilnik N., Mountris K.A., Mansi T., Khamzin S., Dokuchaev A., Solovyova O., Pueyo E., Sermesant M., Sebastian R., Morales H.G., Camara O.. Meshless electrophysiological modeling of cardiac resynchronization Therapy—Benchmark analysis with finite-element methods in experimental data // Applied Sciences (Switzerland). 2022. V. 12(13)
  doi: 3390/app12136438
  IF (2021) = 2.838, Q2
• Khokhlova A., Solovyova O., Kohl P., Peyronnet R. Single cardiomyocytes from papillary muscles show lower preload-dependent activation of force compared to cardiomyocytes from the left ventricular free wall // Journal of Molecular and Cellular Cardiology. 2022. 166, p. 127-136.
  doi: 10.1016/j.yjmcc.2022.02.008
  IF (2021) = 5.763, Q2
• Butova X., Myachina T., Simonova R., Kochurova A., Bozhko Y., Arkhipov M., Solovyova O., Kopylova G., Shchepkin D., Khokhlova A. Peculiarities of the Acetylcholine Action on the Contractile Function of Cardiomyocytes from the Left and Right Atria in Rats // Cells. 2022. V. 11, 3809.
  doi: 3390/cells11233809
  IF (2021)=7.666, Q1
• Parikh J., Rumbell T., Butova X., Myachina T., Acero J.C., Khamzin S., Solovyova O., Kozloski J., Khokhlova A., Gurev V. Generative adversarial networks for construction of virtual populations of mechanistic models: simulations to study Omecamtiv Mecarbil action // Journal of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics. 2022. V. 49, p. 51–64.
  doi: 1007/s10928-021-09787-4
  IF (2021)=2.41, Q4
• Balakina-Vikulova N.A., Katsnelson L.B. Integrative Mathematical Model of Electrical, Metabolic and Mechanical Processes in Human Cardiomyocytes // Journal of Evolutionary Biochemistry and Physiology. V. 58 (Suppl 1), S107–S124.
  doi: 10.1134/S0022093022070122
  IF (2021)=1.621, Q4
• Ryvkin A., Markov N., Yudenko V. Calcium Sparks in Cardiac Pacemaker Cells at Different Temperatures. Computer Modelling // Journal of Evolutionary Biochemistry and Physiology. - 2022. - 58 (Suppl 1), S125 - S133.
  doi: 1134/S0022093022070134
  IF (2021)=1.621, Q4
• Nesterova T., Ushenin K., Solovyova O. Effect of dofetilide on electrophysiological function of human atrial cardiomyocytes in different age groups // AIP Conference Proceedings. 2022. V. 2390, 030062.
  doi: 1063/5.0069260
  Scopus
• Dokuchaev A., Khamzin S., Solovyova O. In Silico Study of Drug-Effects on Cardiomyocytes during Aging // AIP Conference Proceedings. V. 2390, 030012.
  doi: 10.1063/5.0070456
  Scopus
• Bazhutina A., Zubarev S., Budanova M. Accuracy of cardiac scar and fibrosis geometry in ventricular models affects electrical dyssynchrony biomarkers and ML prediction score of CRT response // 2022 Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), 2022, pp. 280-283.
  doi: 1109/CSGB56354.2022.9865443
  Scopus
• Mangileva D., Konovalov P., Kursanov A., Bernikova O., Tsvetkova A., Ovechkin A., Grubbe M., Azarov J., Katsnelson L. Mechanical Manifestation of Complete and Incomplete Spiral Wave Break Up // 2022 IEEE International Multi-Conference on Engineering, Computer and Information Sciences (SIBIRCON). 11-13th November, 2022. Novosibirsk-Yekaterinburg (Hybrid Event). 2022. pp. 530-533.
  doi: 1109/SIBIRCON56155.2022.10016991
  Scopus
• Марков Н.С., Ушенин К.С., Божко Я.Г., Архипов М.В., Соловьёва О.Э. Выделение фенотипов пароксизмальной формы фибрилляции предсердий на основе характеристик вариабельности сердечного ритма // Казанский медицинский журнал. 2021. Т. 102. №5. C. 778-787.
  doi: 17816/KMJ2021-778
  Scopus, РИНЦ
• Чумарная Т.В., Любимцева Т.А., Лебедева В.К., Гасымова Н.З., Лебедев Д.С., Соловьева О.Э. Оценка межжелудочковой электрической задержки при сердечной ресинхронизирующей терапии у пациентов с квадриполярными системами в долгосрочном послеоперационном наблюдении. Российский кардиологический журнал. 2022. Т.27, №7, 5121.
  doi: 15829/1560-4071-2022-5121
  Scopus, РИНЦ
• Архипов М.В., Марков Н.С., Божко Я.Г., Ушенин К.С., Соловьева О.Э. Имеет ли смысл изучение вариабельности сердечного ритма при пароксизмальной форме фибрилляции предсердий во время регистрации эпизода аритмии в структуре записи суточного мониторирования электрокардиограммы? // Российский кардиологический журнал. 2022. Т. 27, №7, 5125.
  doi: 15829/1560-4071-2022-5125
  Scopus, РИНЦ
• Беломестнов С.Р., Севостьянова О.Ю., Чумарная Т.В., Томина Ю.В. Прогноз фетальной макросомии по весу плода в третьем триместре // Уральский медицинский журнал. 2022. Т. 21(5). с. 4-8.
  doi: 52420/2071-5943-2022-21-5-4-8
  РИНЦ

2021

• Peyronnet R, Solovyova O, Iribe G and Katsnelson LB. Editorial: Mechano-calcium, mechano-electric, and mechano-metabolic feedback loops: contribution to the myocardial contraction in health and diseases // Frontiers in Physiology. 2021. V. 12, 418.
  doi: 10.3389/fphys.2021.676826
  ИФ(2020)= 4.566, Q1
• Khamzin S., Dokuchaev A., Bazhutina A., Chumarnaya T., Zubarev S., Lyubimtseva T., Lebedeva V., Lebedev D., Gurev V.,  Solovyova O. Machine Learning prediction of cardiac resynchronisation therapy response from combination of clinical and model-driven data // Frontiers in Physiology. 2021. V. 12, 2283.
  doi: 10.3389/fphys.2021.753282
  ИФ(2020)= 4.566, Q1
• Konovalov P., Mangileva D., Dokuchaev A., Solovyova O., Panfilov A. Rotational activity around an obstacle in 2D cardiac tissue in presence of cellular heterogeneity // Mathematics 2021, 9(23), 3090;
  doi: 10.3390/math9233090
  ИФ(2020)=2.258, Q1
• Rokeakh R., Nesterova T., Ushenin K., Polyakova E., Sonin D., Galagudza M., Tim De Coster, Panfilov A., Solovyova O. Anatomical model of rat ventricles to study cardiac arrhythmias under infarction injury // Mathematics, 2021, 9(20), 2604.
  doi: 10.3390/math9202604
  ИФ(2020)=2.258, Q1
• Mangileva D., Konovalov P., Dokuchaev A., Solovyova O., Panfilov A. Period of arrhythmia anchored around an infarction scar in an anatomical model of the human ventricles // Mathematics, 2021, 9(22), 2911.
  doi: 10.13390/math9222911
  ИФ(2020)=2.258, Q1
• Ushenin K., Kalinin V., Gitinova S., Sopov O., Solovyova O. Parameter variations in personalized electrophysiological models of human heart ventricles // Plos One. 2021. V. 16(4), e0249062.
  doi: 10.1371/journal.pone.0249062
  IF (2020) = 3.24, Q2
• Bazhutina A., Balakina-Vikulova N., Kursanov A., Solovyova O., Panfilov A., Katsnelson L.B. Mathematical modelling of the mechano-electric coupling in the human cardiomyocyte electrically connected with fibroblasts // Progress in Biophysics and Molecular Biology. 2021, V. 159, p. 46-57.
  doi: 10.1016/j.pbiomolbio.2020.08.003
  ИФ(2020)=3.667, Q2
• Чумарная Т.В., Любимцева Т.А., Солодушкин С.И., Лебедева В.К., Лебедев Д.С., Соловьева О.Э. Оценка эффективности сердечной ресинхронизирующей терапии в отдаленном послеоперационном периоде // Российский кардиологический журнал. 2021. Т. 26. №7. С. 48-60
  doi: 15829/1560-4071-2021-4531
  РИНЦ, Scopus
• Balakina-Vikulova N., Katsnelson L. Work Performance in failing myocardium assessed in a mathematical model of the human ventricular myocyte electromechanical coupling // 2021 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), 2021, pp. 1-4
  doi: 10.1109/CSGB53040.2021.9496049
  Scopus
• Dokuchaev A.D., Bazhutina A.E., Khamzin S.Yu., Zubarev S., Solovyova O. Comparison of His-Purkinje and Biventricular pacing in patient-specific computer models // 2021 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), 2021, pp. 400-403.
  doi: 10.1109/CSGB53040.2021.9496032
  Scopus
• Kursanov A.G., Balakina-Vikulova N., Katsnelson L. Arrhythmogenesis in calcium-overloaded human cardiomyocytes in isolation and within cardiac tissue. Simulation study // 2021 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), 2021, pp. 370-373.
  doi: 10.1109/CSGB53040.2021.9496045
  Scopus
• Bazhutina A.E., Dokuchaev A.D., Khamzin S.Yu., Zubarev S., Solovyova O. Comparison of CRT optimization results for different accuracy personalized models // 2021 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), 2021, pp. 420-424.
  doi: 10.1109/CSGB53040.2021.9496023
  Scopus
• Markov N., Ushenin K., Bozhko Y., Arkhipov M., Solovyova O. Heart rate variability reveals two phenotypes of atrial fibrillation // 2021 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), 2021, pp. 460-463.
  doi: 1109/CSGB53040.2021.9496013
  Scopus
• Markov N., Lebedeva E., Gonotkov M., Ryvkin A. In silico study of the ontogenetic changes in action potential properties of mouse cardiac pacemaker cells // 2021 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), 2021, pp. 480-483.
  doi: 10.1109/CSGB53040.2021.9496013
  Scopus
• Mangileva D., Kursanov A., Tsvetkova A., Bernikova O., Ovechkin A., Grubbe M., Azarov J., Katsnelson L. Preprocessing images algorithm without gaussian shaped particles for piv analysis and imaging vortices on the epicardial surface // CEUR Workshop Proceedings, 2021, V. 3027, p. 519-528.
  Scopus

• Марков Н.С., Ушенин К.С., Божко Я.Г., Архипов М.В., Соловьёва О.Э. Выделение фенотипов пароксизмальной формы фибрилляции предсердий на основе характеристик вариабельности сердечного ритма // Казанский медицинский журнал. - 2021. - Т. 102. - №5. - C. 778-787.
  doi: 10.17816/KMJ2021-778
  Scopus, РИНЦ

2020

• Nezlobinsky T., Solovyova O. & Panfilov A.V. Anisotropic conduction in the myocardium due to fibrosis: the effect of texture on wave propagation. Scientifiс 2020, V. 10, 764.
  doi: 10.1038/s41598-020-57449-1
  ИФ(2019) = 3.998, Q1

• Di Achille P., Parikh J., Khamzin S., Solovyova O., Kozloski J., Gurev V. (2020) Model order reduction for left ventricular mechanics via congruency training. PLOS ONE. 2020. V. 15(1), e0219876.
  doi: 10.1371/journal.pone.0219876
  ИФ(2019)= 2.74, Q2
• Pravdin S., Konovalov P., Dierckx H., Solovyova O., Panfilov A.V. Drift of Scroll Waves in a Mathematical Model of a Heterogeneous Human Heart Left Ventricle. Mathematics 2020, V. 8 (5), 776.
  doi: 10.3390/math8050776
  ИФ(2019)= 1.747, Q1
• Dokuchaev A., Panfilov A.V. & Solovyova O. Myocardial Fibrosis in a 3D Model: Effect of Texture on Wave Propagation. Mathematics, 2020. V. 8(8), 1352.
  doi: 10.3390/math8081352
  ИФ(2019)= 1.747, Q1
• Khokhlova A., Konovalov P., Iribe G., Solovyova O. Katsnelson L. The Effects of Mechanical Preload on Transmural Differences in Mechano-Calcium-Electric Feedback in Single Cardiomyocytes: Experiments and Mathematical Models // Frontiers in Physiology, V. 11, 171.
  doi: 10.3389/fphys.2020.00171
  ИФ(2019)= 3.367, Q1
• Balakina-Vikulova N.A., Panfilov A., Solovyova O., Katsnelson L.B. Mechano-calcium and mechano-electric feedbacks in the human cardiomyocyte analyzed in a mathematical model // The Journal of Physiological Sciences. 2020. V. 70, 12.
  doi: 10.1186/s12576-020-00741-6
  ИФ(2019)= 2.955, Q2
• Khamzin S., Dokuchaev A., Solovyova O. Prediction of CRT Response on Personalized Computer Models. // Lecture Notes in Computer Science, 2020. V. 12009. p. 352-363.
  doi: 10.1007/978-3-030-39074-7_37
  WOS
• Nesterova T., Ushenin K., Shmarko D., Solovyova O. Electrophysiological Biomarkers for Age-Related Changes in Human Atrial Cardiomyocytes: In Silico Study // ITM Web of Conferences. 2020. V. 31, 01004.
  doi: 10.1051/itmconf/20203101004
  WOS
• Dokuchaev A., Khamzin S., Solovyova O. In-silico study of age-related ionic remodeling in human ventricular cardiomyocytes // BIO Web Conf. 2020., V. 22, 01024.
  doi: 10.1051/bioconf/20202201024
  WOS
• Nesterova, T., Shmarko, D., Ushenin, K., Solovyova, O. In-silico analysis of aging mechanisms of action potential remodeling in human atrial cardiomyocites // BIO Web of Conferences. 2020. V. 22, 01025.
  doi: 10.1051/bioconf/20202201025
• Ushenin K., Nesterova T., Shmarko D., Sholokhov V. Phase Mapping for Cardiac Unipolar Electrograms with Neural Network Instead of Phase Transformation // 2020 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology (USBEREIT), Yekaterinburg, Russia, 2020, p. 117-120.
  doi: 10.1109/USBEREIT48449.2020.9117627
  Scopus
• Sholokhov VD, Ushenin KS, Zverev VS, Kursanov AG. Dependence of the left ventricular ejection fraction on the myocardial fiber orientation in the mechanical model // 2020 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology (USBEREIT), Yekaterinburg, Russia, 2020, p. 0024-0027.
  doi: 10.1109/USBEREIT48449.2020.9117769
  Scopus
• Markov N, Ryvkin A. Simulation of the Submembrane Calcium Diffusion in Cardiac Cells // 2020 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology (USBEREIT), Yekaterinburg, Russia, 2020, p. 207-210.
  doi: 10.1109/USBEREIT48449.2020.9117714
  Scopus
• Zyuzin V., Neustroev D., Mukhtarov A., Chumarnaya T. Segmentation of 2D Echocardiography Images using Residual Blocks in U-Net Architectures // 2020 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology (USBEREIT), Yekaterinburg, Russia, 2020, p. 499-502.
  doi: 10.1109/USBEREIT48449.2020.9117678
  Scopus
• Mangileva D., Dokuchaev A., Khamzin S., Lyubimtseva, Solovyova O., Zubarev S., Lebedev D. Removing Artifacts from the Computed Tomography Images of the Heart Using Neural Network with Partial Convolution Layer // 2020 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology (USBEREIT), Yekaterinburg, Russia, 2020, p. 195-198.
  doi: 10.1109/USBEREIT48449.2020.9117624
  Scopus
• Markov N.S., Ryvkin A.M. Studying the peculiarities of calcium sparks formation process in cardiac cells // Mathematical Analysis With Applications (S. Pinelas et al (eds.)). In Springer Proceedings in Mathematics & Statistics, 2020. V. 318.  p. 253-264.
  doi: 10.1007/978-3-030-42176-2_25
  WOS, Scopus
• Ryvkin A.M., Budeeva E.A. Modeling the effect of ion channels inhibitors on the functioning of cardiac sinoatrial node cells // Mathematical Analysis With Applications (S. Pinelas et al (eds.)). In Springer Proceedings in Mathematics & Statistics, 2020. V. 318. p. 301-309.
  doi: 10.1007/978-3-030-42176-2_29
  WOS, Scopus
• Nesterova Т., Shmarko D., Ushenin K., Solovyova O. Age-dependent effects of chronic atrial fibrillation remodeling in population of human atrial cardiomyocyte models // AIP Conference Proceedings. 2020. V. 2313, 080020.
  doi: 10.1063/5.0033019
  Scopus
• Rokeakh R., Zaripov Z., Nesterova T., Averchenko M., Zayakin M., Ushenin K., Solovyova O. Algorithm for search of abnormalities in populations of cardiomyocyte mathematical models // AIP Conference Proceedings. 2020. V. 2313, 080025
  doi: 10.1063/5.0032246
  Scopus
• Rokeakh R., Ushenin K., Chumarnaya T., Alueva Y., Mikhailov S., Idov E., Solovyova O. Unsupervised learning reveals two phenotypes of left ventricle contraction in patients with heart failure // AIP Conference Proceedings. 2020. V. 2313(1). 070026.
  doi: 10.1063/5.0032269
  Scopus
• Samun V. S., Sheka A. S., Chumarnaya T. V., Solovyova O. E. Comparison of neural network architectures for segmentation of the left ventricle on EchoCG images // AIP Conference Proceedings.  2020. V. 2313, 070014.
  doi: 10.1063/5.0032165
  Scopus

• Ковтун О.П., Цывьян П.Б., Маркова Т.В., Чумарная Т.В. Ремоделирование сердца недоношенных детей // Вестник Российской академии медицинских наук, 2020. Т. 75(6). с. 631–637.
  doi: 15690/vramn1268
  РИНЦ

• Чумарная Т.В., Идов Э.М., Кондрашов К.В., Михайлов С.П., Климушева Н.Ф., Быков А. Н., Кочмашева В.В., Алуева Ю.С., Соловьева О.Э. Сравнительная оценка стандартного эхокардиографического исследования и классификационной модели на основе параметров функциональной геометрии левого желудочка в диагностике систолической дисфункции трансплантированного сердца // Сибирский медицинский журнал. 2020. Т. 35(1), c. 107-116.
  doi: 10.29001/2073-8552-2020-35-1-107–116
  РИНЦ
• Чумарная Т.В., Идов Э.М., Кондрашов К.В., Михайлов С.П., Климушева Н.Ф., Быков А.Н., Кочмашева В.В., Алуева Ю.С., Соловьева О.Э. Классификационная модель, основанная на параметрах функциональной геометрии левого желудочка, как новый фактор для ранней диагностики острого отторжения трансплантированного сердца // Вестник уральского государственного медицинского университета. 2020. Т. 1-2. с. 75-78.
  РИНЦ
• Цывьян П.Б., Мальгина Г.Б., Кодкин В.Л., Косовцова Н.В., Маркова Т.В., Краева О.А., Мангалиева Д.В. Индекс производительности миокарда плода: физиология и клиническое значение // Акушерство и гинекология. 2020. Т. 10, с. 20-27.
  doi: 10.18565/aig.2020.10.20-27
  РИНЦ, Scopus

2019

• Bazhutina A., Balakina-Vikulova N., Katsnelson L., Panfilov A.V., Solovyova O. Electromechanical Coupling in Cardiomyocytes Depends on Its Electrotonic Interaction With Fibroblasts: Simulation Study // Computing in Cardiology. V. 46.  2019. p. 1-4.
  doi: 10.22489/cinc.2019.237
  WOS, Scopus
• Sholohov V., Zverev V., Kursanov A. Investigation of Mechanisms of Regulation of Electromechanical Function of Cardiomyocytes in the Biomechanical Model of Myocardium // Computing in Cardiology.  2019. V. 45. 9005625. p. 1-4.
  doi: 10.22489/CinC.2019.211
  WOS, Scopus
• Ushenin K., Detkov N., Nesterova T., Shmarko D., Razumov A.A., Solovyova O. Unsupervised Learning to Analysis of Population of Models in Computational Electrophysiological Studies  // International Multi-Conference on Engineering, Computer and Information Sciences (SIBIRCON). IEEE. 2019. p. 0379 - 0383.
  doi: 10.1109/SIBIRCON48586.2019.8958141
  Scopus
• Sheka A., Samun V., Chumarnaya T., Solovyova O. Segmentation of the Left Ventricle on EchoCG Images Using MultiResUnet // International Multi-Conference on Engineering, Computer and Information Sciences (SIBIRCON). IEEE. 2019. p. 0775-0779.
  doi: 10.1109/SIBIRCON48586.2019.8958128
  Scopus
• Dokuchaev A., Khamzin S., Mangileva D., Chumarnaya T.,  Solovyova O. Impact of transmural dimension of myocardial infarction on the dynamics of spiral waves in realistic models of human heart left ventricle // Proceedings - 2019 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology, USBEREIT 2019, 2019. p. 131-134.
  doi: 10.1109/USBEREIT.2019.8736650
  Scopus
• Zyuzin V., Chumarnaya  T. Comparison of Unet architectures for identification of the left ventricle endocardial border on two-dimensional ultrasound images // Proceedings - 2019 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology, USBEREIT 2019, 2019. p. 110-113.
  doi: 10.1109/USBEREIT.2019.8736616
  Scopus
• Bazhutina A., Balakina-Vikulova N., Solovyova O., Katsnelson L. Mathematical model of electrotonic interaction  between mechanically active cardiomyocyte and fibroblasts // Proceedings - 2019 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology, USBEREIT 2019, 2019. p. 114-117.
  doi: 10.1109/USBEREIT.2019.8736669
  Scopus
• Razumov A.A., Ushenin K.S., Potekhina V.M., Shmarko D., Solovyova O. Processing of Cardiac Optical Mapping Data for Cameras with Hexagonally Packed Photodiode Array. K-means Cluster Maps for Experiment Analysis // Proceedings - 2019 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology, USBEREIT 2019, 2019. p. 32-35.
  doi: 10.1109/USBEREIT.2019.8736678
  Scopus
• Ushenin K., Nesterova T., Shmarko D., Razumov A. Approximation of Action Potential in Populations of Cardiomyocyte Electrophysiology Models // Proceedings - 2019 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology, USBEREIT 2019, 2019. p. 182-185.
  doi: 10.1109/USBEREIT.2019.8736682
  Scopus
• Ryvkin A.M., Markov N.S. Age-related Calcium Sparks Alterations in Heart Pacemaker Cells. Computer Modeling // Proceedings - 2019 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology, USBEREIT 2019, 2019. pp 163-166.
  doi: 10.1109/USBEREIT.2019.8736661
  Scopus
• Shmarko D., Nesterova T., Ushenin K. Analysis of approaches to building a probability density function for the mathematical model parameters of rat atrial cardiomyocytes // AIP Conference Proceedings. 2019. V. 2174, p. 020254-1—020254-6. 
  doi: 10.1063/1.5134405
  WOS, Scopus
• Nesterova T., Shmarko D., Ushenin K. In silico study of cardiomyocytes aging in human and canine atriums // AIP Conference Proceedings. 2019.  V. 2174, p. 020231-1—020231-4.
  doi: 10.1063/1.5134382
  WOS, Scopus
• Мангилева Д.В., Докучаев А.Д., Хамзин С.Ю., Чумарная Т.В., Соловьева О.Э. Исследование влияния постинфарктного рубца на динамику спиральных волн в моделях левого желудочка сердца человека // Дневник казанской медицинской школы. 2019. T. 1 (23). с. 57-61.
  РИНЦ
• Чумарная Т.В., Быков А. Н., Михайлов С.П., Идов Э.М., Соловьева О.Э. Оценка систолической функции трансплантированного сердца с помощью классификационной модели на основе параметров функциональной геометрии левого желудочка сердца // Дневник казанской медицинской школы. 2019. T. 1 (23). с. 116-120.
  РИНЦ

2018

• Khokhlova A., Iribe G., Katsnelson L., Naruse K., Solovyova O. The effects of load on transmural differences in contraction of isolated mouse ventricular cardiomyocytes // J Mol Cell Cardiol. 2018. V. 114, p. 276–287.
  doi: 10.1016/j.yjmcc.2017.12.001
  IF(2017)=5.296, Q1
• Di Achille P., Harouni A., Khamzin S., Solovyova O., John Rice J., Gurev V. Gaussian Process regressions for inverse problems and parameter searches in models of ventricular mechanics // Frontiers in Physiology. 2018. V. 9, 1002.
  doi: 10.3389/fphys.2018.01002
  IF(2017) - 3.394, Q1
• Khokhlova A., Balakina-Vikulova N., Katsnelson L., Iribe G., Solovyova O. Transmural cellular heterogeneity in myocardial electromechanics // The Journal of Physiological Sciences, 2018. V. 68(4), p. 387-413.
  doi: 10.1007/s12576-017-0541-0
  IF(2016)=2.075, Q2
• Razumov A.A., Ushenin K.S., Butova K., Solov’eva O.E. The study of the influence of heart ventricular wall thickness on pseudo-ECG // Russ. J. Numer. Anal. Math. Modelling, 2018. V. 33(5), p. 301-313.
  doi: 10.1515/rnam-2018-0025
  IF(2017)=0.662, Q4
• Chumarnaya T.V., Kraeva O.A., Tsyvian P.B., Solovyova O.E. Functional geometry of the left ventricle in term newborns with different birth weights // Human Physiology, 2018. V. 44(5), p. 565–573.
  doi: 10.1134/S0362119718030040
  РИНЦ, Scopus
• Nesterova T. M., Ushenin K. S., Balakina-Vikulova N. A., and Solovyova O. Study of calcium overload in one-dimensional cardiac model. Role of spatial distribution of pathology // Mathematical Biology and Bioinformatics, 2018. V. 13, p. 467-479.
  doi: 10.17537/2018.13.466
  РИНЦ, Scopus
• Khamzin S.,  Dokuchaev A.,  Bazhutina A., Zubarev S., Chumarnaya T., Lyubimtseva T., Lebedev D., Solovyova O. Optimization of left ventricular lead position based on a computer model of the heart for cardiac resynchronization therapy //  2018 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology (USBEREIT), 2018.  pp. 68-71.
  doi: 10.1109/USBEREIT.2018.8384552
  WOS, Scopus
• Zyuzin V., Porshnev S., Mukhtarov A., Chumarnaya T., Solovyova O., Bobkova A., Myasnikov V. Identification of the left ventricle endocardial border on two-dimensional ultrasound images using the convolutional neural network Unet // 2018 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology (USBEREIT), 2018.  pp. 76-78.
  doi: 10.1109/USBEREIT.2018.8384554
  WOS, Scopus
• Sulman T., Solovyova O., Katsnelson L. Combined mathematical model of the electrical and mechanical activity of the human cardiomyocyte // 2018 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology (USBEREIT), 2018.  pp. 25-28.
  doi: 10.1109/USBEREIT.2018.8384541
  WOS, Scopus
• Ryvkin A., Markov N. Modeling of calcium sparks in heart cells. 2D calcium diffusion problem. // 2018 Ural Symposium on Biomedical Engineering, Radioelectronics and Information Technology (USBEREIT), 2018. p. 107-110.
  doi: 10.1109/USBEREIT.2018.8384562
  WOS, Scopus
• Ryvkin A., Markov N. RyRs Coupling Causes a Calcium Leak in Cardiac Cell // Computing in Cardiology. 2018. V. 45. p.1-4.
  doi: 10.22489/CinC.2018.323
  WOS, Scopus
• Chumarnaya T., Mikhaylov S.P., Idov E.M., Solovyova O. Classification Model of Heart Transplant Outcomes Based on Features of Left Ventricular Functional Geometry // Computing in Cardiology. 2018. V. 45. p.1-4.
  DOI: 10.22489/CinC.2018.028
  WOS, Scopus
• Balakina-Vikulova N., Solovyova O., Panfilov A., Katsnelson L. Mechano-Electric Feedbacks in a New Model of the Excitation-Contraction Coupling in Human Cardiomyocytes // Computing in Cardiology. 2018. V. 45. p. 1-4.
  doi: 10.22489/CinC.2018.065
  WOS, Scopus
• Katsnelson L., Konovalov P., Solovyova O. New Mathematical Model of Electromechanical Coupling in Rat Cardiomyocytes  // Computing in Cardiology. 2018. V. 45. p. 1-4.
  doi: 10.22489/CinC.2018.062
  WOS, Scopus
• Kursanov A., Zverev V., Katsnelson L., Solovyova O. Detailed Electromechanical Model of Ventricular Wedge // Computing in Cardiology. 2018. V. 45. p. 1-4.
  doi: 10.22489/CinC.2018.280
  WOS, Scopus

2017

• Khokhlova A., Balakina-Vikulova N., Katsnelson L., Solovyova O. Effects of cellular electromechanical coupling on functional heterogeneity in a one-dimensional tissue model of the myocardium // Computers in Biology and Medicine. 2017. V. 84, p. 147-155.
  doi: 10.1016/j.compbiomed.2017.03.021
  IF(2016)=1.836
• Iaparov B.I., Khamzin S.Yu., Moskvin A.S., Solovyova O.E. Mathematical modeling shows the frequency of Ca2+ sparks in cells depends on the ryanodine receptor’s arrangement // Procedia Computer Science. 2017. V. 119, p. 190-196.
  doi: 10.1016/j.procs.2017.11.176
  WOS, Scopus
• Iaparov, B., Moskvin, A.S., Solovyova, O.E. Temperature sensitivity of ligand-gated ion channels: Ryanodine receptor case // Journal of Physics: Conference Series. 2017. V. 929(1), p. 012019
  doi: 10.1088/1742-6596/929/1/012019
  Scopus
• Chumarnaya  T., Trifanova M., Lyubimtseva T., Lebedeva V., Poroshin I.,  Trukshina M., Lyasnikova E., Sitnikova M., Lebedev D., Solovyova O. Impact of Interventricular Lead Distance on Cardiac Resynchronization Therapy Outcomes // Computing in Сardiology. 2017. V. 44, p.1-4.
  doi: 10.22489/CinC.2017.290-106
  WOS, Scopus
• Ковтун О.П., Цывьян П.Б., Соловьева О.Э. Перинатальное программирование и старение кардиомиоцитов // Российский вестник перинатологии и педиатрии. 2017.  Т. 62(1), с. 33-39.
  doi: 10.21508/1027-4065-2017-62-1-33-39
  РИНЦ

Наиболее цитируемые публикации до 2017 года
(более 10 цитирований по WoS на 01.11.2023):

• Markhasin V.S., Solovyova O., Katsnelson L.B., Protsenko Y., Kohl P., Noble D. Mechano-electric interactions in heterogeneous myocardium: development of fundamental experimental and theoretical models // Progress in Biophysics and Molecular Biology, 2003. V. 82(1—3). P. 207—220.
  doi: 1016/S0079-6107(03)00017-8
• Izakov V.Ya., Katsnelson L.B., Blyakhman F.A., Markhasin V.S., Shklyar T.F. Cooperative effects due to calcium binding by troponin and their consequences for contraction and relaxation of cardiac muscle under various conditions of mechanical loading // Circulation Research, 1991. V. 69. P. 1171-1184.
  doi: 1161/01.res.69.5.1171
• Quinn T.A., Granite S., Allessie M.A., Antzelevitch C., Bollensdorff C., Bub G., Burton R.A.B., Cerbai E., Chen P.S., Delmar M., DiFrancesco D., Earm Y.E., Efimov I.R., Egger M., Entcheva E., Fink M., Fischmeister R., Franz M.R., Garny A., Giles W.R., Hannes T., Harding S.E., Hunter P.J., Iribe G., Jalife J., Johnson C.R., Kass R.S., Kodama I., Koren G., Lord P., Markhasin V.S., Matsuoka S., McCulloch A.D., Mirams G.R., Morley G.E., Nattel S., Noble D., Olesen S.P., Panfilov A.V., Trayanova N.A., Ravens U., Richard S., Rosenbaum D.S., Rudy Y., Sachs F., Sachse F.B., Saint D.A., Schotten U., Solovyova O., Taggart P., Tung L., Varró A., Volders P.G., Wang K., Weiss J.N., Wettwer E., White E., Wilders R., Winslow R.L., Kohl P. Minimum Information about a Cardiac Electrophysiology Experiment (MICEE): Standardised reporting for model reproducibility, interoperability, and data sharing  // Progress in Biophysics and Molecular Biology, 2011. V. 107 (1), p. 4-10
  doi: 1016/j.pbiomolbio.2011.07.001
• Pravdin S.F., Berdyshev V.I., Panfilov A.V., Katsnelson L.B., Solovyova O., Markhasin V.S. Mathematical model of the anatomy and fibre orientation field of the left ventricle of the heart // BioMedical Engineering OnLine, 2013. V. 12(1), 18.
  doi: 1186/1475-925X-12-54
• Solovyova O., Vikulova N., Katsnelson L.B., Markhasin V.S., Noble P.J., Garny A.F., Kohl P., Noble D. Mechanical interaction of heterogeneous cardiac muscle segments in silico: effects on Ca2+ handling and action potential // Int J of Bifurcation & Chaos, 2003. V. 13(12). P. 3757— 3782.
  doi: 1142/S0218127403008983
• Sulman T., Katsnelson L.B., Solovyova O., Markhasin V.S. Mathematical Modeling of Mechanically Modulated Rhythm Disturbances in Homogeneous and Heterogeneous Myocardium with Attenuated Activity of Na+-K+ Pump. // Bulletin of Mathematical Biology. V. 70 №3, Р. 910-949, 2008.
  doi: 1007/s11538-007-9285-y
• Pravdin S.F., Dierckx H., Katsnelson L.B., Solovyova O., Markhasin V.S., Panfilov A.V. Electrical Wave Propagation in an Anisotropic Model of the Left Ventricle Based on Analytical Description of Cardiac Architecture // PloS one. 2014. V. 9 (5). e93617.
  doi: 1371/journal.pone.0093617
• Katsnelson L.B., Nikitina L.V., Chemla D., Solovyova O., Coirault C., Lecarpentier I., Markhasin V.S. Influence of viscosity on myocardium mechanical activity: A mathematical model. // Journal of Theoretical Biology. 2004. Vol. 230(3), p. 385-405
  doi: 1016/j.jtbi.2004.05.007
• Katsnelson L.B., Markhasin V.S. Мathematical modeling of relations between the kinetics of free intracellular calcium and mechanical function of myocardium // Journal of Molecular and Cellular Cardiology. 1996. V. 28. № 3. p. 475-486.
  doi: 1006/jmcc.1996.0044
• Solovyova O., Katsnelson L., Guriev S., Nikitina L., Protsenko Yu., Routkevitch S., Markhasin V. Mechanical inhomogeneity of myocardium studied in parallel and serial cardiac muscle duplexes: experiments and models. // Chaos, Solitons & Fractals. 2002. V. 13. P. 1685-1711.
  doi: 1016/S0960-0779(01)00175-8
• Solovyova O., Katsnelson L.B., Kohl P., Konovalov P., Lookin O., Moskvin A.S., Vikulova N., Protsenko Yu.L., Markhasin V.S. Activation sequence as a key factor in spatio-temporal optimization of myocardial function. Philosophical Transactions of the Royal Society A., 2006, V. 364. p. 1367–1383
  doi: 1098/rsta.2006.1777
• Markhasin V.S., Balakin A., Katsnelson L.B., Konovalov P., Lookin O., Protsenko Yu., Solovyova O. Slow force response and auto-regulation of contractility in heterogeneous myocardium // Progress in Biophysics and Molecular Biology. 2012. V. 110, p. 305-318.
  doi: 1016/j.pbiomolbio.2012.08.011
• Katsnelson L.B., Solovyova O., Balakin A., Lookin O., Konovalov P., Protsenko Y., Sulman T., Markhasin V.S. Contribution of mechanical factors to arrhythmogenesis in calcium overloaded cardiomyocytes: Model predictions and experiments // Progress in Biophysics and Molecular Biology. 2011, V. 107(1), p. 81-89.
  doi: 1016/j.pbiomolbio.2011.06.001
• Solovyova O., Katsnelson L. B., Kohl P., Panfilov A. V., Tsaturyan A. K., Tsyvian P. B. Mechano-electric heterogeneity of the myocardium as a paradigm of its function // Progress in Biophysics and Molecular Biology. 2016. V. 120(1-3). P. 249–254.
  doi 1016/j.pbiomolbio.2015.12.007
• Pravdin S., Dierckx H., Markhasin V. S., Panfilov A. V. Drift of scroll wave filaments in an anisotropic model of the left ventricle of the human heart // BioMed Research International. 2015. V. 2015, 389830
  doi: 1155/2015/389830
• Solovyova O., Katsnelson L.B., Konovalov P.V., Kursanov A.G., Vikulova N.A., Kohl P. and Markhasin V.S. The cardiac muscle duplex as a method to study myocardial heterogeneity // Progress in Biophysics and Molecular Biology. 2014. V.115, p. 115-128.
  doi: 1016/j.pbiomolbio.2014.07.010
• Katsnelson L.B., Sulman T., Solovyova O., Markhasin V.S. Role of myocardial viscoelasticity in disturbances of electrical and mechanical activity in calcium overloaded cardiomyocytes: Mathematical modeling // Journal of Theoretical Biology. 2011. V. 272(1). P. 83-95.
  doi: 1016/j.jtbi.2010.11.035
• Vikulova N.A., Katsnelson L.B., Kursanov A.G., Solovyova O., Markhasin V.S. Mechano-electric feedback in one-dimensional model of myocardium // Journal of Mathematical Biology. 2016. V. 73, pp. 335–366.
  doi: 1007/s00285-015-0953-5
• Solovyova O.E., Vikulova N.A., Konovalov P.V., Kohl P., Markhasin V.S. Mathematical modelling of mechano-electric feedback in cardiomyocytes // Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling. 2004. V. 19(4), p. 331–35.
  doi: 1515/rnam.2004.19.4.331
• Shchepkin D.V., Kopylova G.V., Nikitina L.V., Katsnelson L.B., Bershitsky B.Y. Effects of cardiac myosin binding protein-C on the regulation of interaction of cardiac myosin with thin filament in an in vitro motility assay // Biochemical and Biophysical Research Communications. 2010. V. 401. P. 159-163.
  doi: 1016/j.bbrc.2010.09.040
• Katsnelson L.B., Izakov V.Ya., Markhasin V.S. Heart muscle: Mathematical modeling of the mechanical activity and modeling of mechanochemical uncoupling // General Physiology and Biophysics, 1990. V. 9. P. 218-244.
  ссылка
• Nikitina L.V., Kopylova G.V., Shchepkin D.V., Katsnelson L.B. Study of the interaction between rabbit cardiac contractile and regulatory proteins. An in vitro motility assay // Biochemistry (Moscow), 2008. V. 73, p. 178-184.
  doi: 10.1134/S0006297908020090

Информация о материале

Uncategorised

01 апреля 2015

Просмотров: 2448

• Osier F., Ting J., Fraser J....Chereshnev V...Suchard M. The global response to the COVID-19 pandemic: how have immunology societies contributed? // Rev. Immunol. - 2020. - Vol. 20(10). - P. 594-602. doi: 10.1038/s41577-020-00428-4
• Savinkov R., Grebennikov D., Puchkova D., Chereshnev V., Sazonov I., Bocharov G. Graph theory for modelling and analysis of the human lymphatic system // - 2020. – Vol. 8(12). – P. 2236 doi: 10.3390/math8122236
• Кривопалов С.А., Юшков Б.Г., Быкова М.Ю., Забегалов К.Н. Половые отличия пула свободных аминокислот-нейромедиаторов у крыс Крушинского-Молодкиной // Биомедицинская химия, 2020. - т.66, № 2. - С.124-129. doi: 10.18097/PBMC20206602124
• Черешнев В.А., Гаврилова Т.В., Черешнева М.В., Сергиенко А.П., Воробьева Н.Н. Офтальмопатология в ряду вторичных заболеваний пациентов с тяжелой формой ВИЧ-инфекции // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии, - т.12, № 2.- С. 97–103. doi: 10.22328/2077-9828-2020-12-2-97-103
• Юшков Б.Г., Бриллиант С. А. Особенности распределения различных изоформ гемоглобина в эритроцитах крыс // Российский физиологический журнал им. И. М. Сеченова, 2020, т.106, №10. - С. 1312-1320. doi: 10.31857/S0869813920090095
• Юшков Б.Г., Черешнев В.А., Бриллиант С.А. Гетерогенная система гемоглобинов и ее роль в физиологии и патофизиологии (Обзор) // Клиническая патофизиология, 2020, №.2. – С. 22-36.
• Храмцова Ю.С., Арташян О.С., Тюменцева Н.В., Юшков Б.Г., Бухарина А.Ю. Тучные клетки и сперматогенез в норме и при повреждении // Бюллетень сибирской медицины, 2019, т.18, №1.- С. 237-246. DOI 10.20538/1682 -0363-2019-1-237-246
• Конькова А.Ю., Горовиц Э.С., Гаврилова Т.В., Пожарицкий М.Д., Черешнева М.В. Роль комплексного клинико-анамнестического и лабораторного обследования при уточнении этиологии эндогенных увеитов / Офтальмология, 2019, т.16, №2. – С. 202-209. DOI: 10.18008/1816-5095-2019-2-202-209
• Усачев В.А., Арташян О.С., Котомцев В.В., Сенькин Г.С., Солосина Д.А. Применение фиброзного аутотрансплантата в посттравматической костной регенерации нижней челюсти // Acta Biomedica Scientifica, 2019, т.4, № 1. – С.162-165. DOI: 10.29413/ABS.2019-4.1.25
• Shmagel, K.V., Chereshnev, V.A. Immune status in HIV-infected patients coinfected with hepatitis C virus (HCV)(Article) HIV Infection and Immunosuppressive // Disorders. - 2019. - Vol. 10(4). – P. 25-36. DOI 10.22328/2077-9828-2018-10-4-25-36
• Krivopalov S.A., Yushkov B.G. Amplitude analysis of audiogenic epileptiform seizure of Krushinsky-Molodkina rat strain.//Neurochemical Journal – 2018. 12(4). DOI: 10.1134/S1819712418040050
• Храмцова Ю.С., Тюменцева Н.В., Юшков Б.Г., Жилякова М. А. Реакция тучных клеток семенников на стресс разной интенсивности // Морфология, 2018, т.153, №2. - С. 47-51.
• Юшков Б.Г. Клетки иммунной системы и регуляция регенерации // Бюллетень сибирской медицины, 2017, т.16, №4. – С. 94-105.
• Антропова И.П., Рейно Е. В., Юшков Б. Г. Клоттинговые тесты и молекулярные маркеры в оценке коагуляционных изменений на фоне антитромботической профилактики дабигатраном после крупных ортопедических операций // Клиническая лабораторная диагностика, 2017, т.62, № 1.- С. 25-30
• Shilov J.I., Chereshneva M.V., Gavrilova T.V., Usova V.V., Chereshnev V.A. Changes of immune system function and its correction under penetrating eye injury // New Frontiers in Ophtalmology.- - Vol. 3(4).- P. 1-7.
• Гаврилова Т.В., Гейн С.В., Никитина А.А., Гейн О.Н., Черешнева М.В., Черешнев В.А., Кириллина Е.А. Влияние МП-5 и МП-6 на микробицидную активность и продукцию IL-1βIL-10 перитониальными макрофагами при стрессе // Медицинская иммунология, 2017, т.19. - С. 21.
• Павлов В.А., Котомцев В.В., Доронин А.И., Сабадаш Е.В. Антиоксидантные и антимутагенные метаболиты у животных с противоположной чувствительностью к микобактериям туберкулёза и мутагенным ксенобиотикам // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2016. т.162. - С.75-79.
• Храмцова Ю.С., Тюменцева Н.В., Юшков Б.Г., Силантьева Е. А., Медведева С.Ю., Бызов И.В., Уймин М.А., Ермаков А.Е. Реакция лимфоидных органов на введение железоуглеродных наночастиц // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2016, т. 162, №8. – С. 218 – 221.
• Гаврилова Т.В., Конькова А.Ю., Соснин Б.Ю. , Черешнева М.В. Определение уровня прокальцитонина в сыворотке крови и слезной жидкости пациентов с увеитами // Медицинский альманах,  2016, т.41, №1. - С. 92-95.
• Храмцова Ю.С., Арташян О.С., Юшков Б.Г., Волкова Ю.Л., Незговорова Н.Ю. Влияние тучных клеток на репаративную регенерацию тканей с разной степенью иммунологической привилегированности // Цитология, 2016, т. 58, №5. - С. 356-363
• Тюменцева Н.В., Юшков Б.Г., Медведева С.Ю. Новый метод получения аутопротезов для пластики различных органов // Вестник трансплантологии и искусственных органов, 2016. – С.219.
• Тюменцева Н. В., Юшков Б. Г., Медведева С.Ю., Коваленко Р.Ю., Узбеков О.К., Журавлев В.Н. Возможность применения соединительнотканных протезов для аутопластики дефектов стенки мочевого пузыря //Урология, 2016, №6. – С. 60-64.
• Antropova I.P., Yushkov B.G., Kobrinsky E., Varaksin A.N. Soluble thrombomodulin and major orthopedic surgery // International Journal of Biomedicine. – 2016.- Vol. 6(3). - Р.213-217.
• Кривопалов С.А., Юшков Б.Г. Половые особенности припадка и поведения крыс линии Крушинского-Молодкиной/ Журнал Высшей нервной деятельности, 2015, т.65, №5. С. 1-11.
• Юшков Б.Г., Арташян О.С., Медведева С.Ю., Бызов И.В., Уймин М.А., Ермаков А.Е., Быкова М.Ю., Петрова И.М. Оценка биораспределения функционализированных наночастиц со структурой " магнитное ядро-углеродная оболочка" при системном способе введения / Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2015, т.159, №4.- С. 495-499.
• Антропова И.П., Юшков Б.Г. Исходное функциональное состояние эндотелия и реакция системы гемостаза на крупное хирургическое вмешательство/ Тромбоз, гемостаз и реология, 2015, т.64, №4. - С. 50-58.
• Конькова А.Ю., Соснин Д.Ю., Гаврилова Т.В., Черешнева М.В. Исследование прокальцитонина в слезной жидкости и сыворотке крови при увеитах// Клиническая лабораторная диагностика, 2015, т. 60, №10. – С. 21-26.
• Черешнев В.А. и др. Молекулярная эпидемиология и выбор прототипных штаммов ВИЧ-1 с целью конструирования кандидатных отечественных анти-вич-вакцин // Иммунология, 2015, т.36, №5. С. 268-275.
• Bocharov G., Kim A., Krasovskii A., Chereshnev V., Glushenkova V., Ivanov A. An extremal shift method for control of HIV infection dynamics. // Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling. – 2015. - Vol. 30 (1). - P.11-25.
• Bocharov G., Telatnikov I., Chereshnev V.A., Martinez J., and Meyerhans A.. Mathematical modelling of the within-host HIV quasispecies dinamics in response to antiviral treatment. // J. Numer. Anal. Math. Modelling. – 2015. – Vol. 30 (3), - P. 157-170.– doi: 10.1515/rnam-2015-0015.
• Sidorova L.P., Tseitler T.A., Perova N.M., Emelyanov V.V., Savateeva E.A., Maksimova N.E., Mochulskaya N.N., Chereshnev V.A., Chupakhin O.N. Synthesis of new 1,3,4-thiadiazines capable of inhibiting nonenzymatic glycosylation of proteins // Pharmaceutical Chemistry Journal. – - Vol. 49(8). - P. 501 – 505.
• Yushkov , N. Tyumentseva, V. Khodakov, S. Medvedeva, D. Krokhin, K. Plaksin, M. Rantsev, P. Sarapultsev, A. Sarapultsev The technique for receiving vascular autoprostheses for angioplasty // Gazzetta Medica Italiana Archivio per le Scienze Mediche. – 2015. – Vol. 174(1-2). – Р.23-31.
• Данилова И.Г., Казакова И.А., Юшков Б.Г., Абидов М.Т. Модуляция макрофагов и реакции СD117+ - клеток различной локализации при повреждении печени у мышей//Бюллетень эксперим. Биологии и медицины, 2014, т.157, №3. – С. 335-338.
• Черешнева М. В. Влияние МП-3 на динамику респираторного взрыва и продукцию IL-1β и TNF-α перитонеальными макрофагами мыши при стрессе in vivo //Доклады Академии наук, 2014, т.455, №2. - С. 232-234.
• Забокрицкий Н.А., Ларионов Л.П., Юшков Б.Г., Киселева А.А. Доклиническая оценка иммунотропного действия разработанного экспериментального образца пробиотического препарата бацилакт в составе трансдермальных терапевтических систем // Российский иммунологический журнал, 2014, т.8, №3. – С.680-684.
• Юшков Б.Г. Модуляция макрофагов и реакции CD117+ клеток различной локализации при повреждении печени у мышей // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2014, т.157, №3. - С.335-338.
• Храмцова Ю.С. Арташян О.С., Пугачев Н.Н. Репаративная регенерация семенников при различных повреждениях гемато-тестикулярного барьера // Экспериментальная и клиническая урология, 2014, №2. – С. 14-18.
• Chereshnev V.A, Kosareva P.V., Samodelkin E.I., Sivakova L.V. A new experimental model of hemolytic anemia after butoxyethanol and the study of its immunology// Hellenic Journal of Nuclear Medicine. – 2014. - 7-10.

Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M., Bazhan S.I., Gainova I.A., Chereshnev V.A., Bocharov G.A.  Mathematical model of the Tat-Rev regulation of HIV-1 replication in an activated  cell predicts the existence of oscillatory dynamics in the synthesis of viral components // BMC Genomics. - 2014. – Vol. 15(12). – P. 1-18.